RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261206.7

ACSS3-201, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACSS3, Length 2,666 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3-201ENST00000261206 PTPN4P29074 926 aa20.18■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 CAV1Q03135 178 aa20.18■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 GABPAQ06546 454 aa20.18■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 SPARCL1Q14515 664 aa20.18■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 GRIPAP1Q4V328 841 aa20.18■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 IRGCQ6NXR0 463 aa20.18■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 MTHFD1LQ6UB35 978 aa20.18■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 TRABD2AQ86V40 505 aa20.18■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 SLC47A2Q86VL8 602 aa20.18■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.18■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 DENND1AQ8TEH3 1009 aa20.18■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 MIPEPQ99797 713 aa20.18■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 PLVAPQ9BX97 442 aa20.18■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 GLT8D2Q9H1C3 349 aa20.18■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 SIGLEC16A6NMB1 481 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 SORBS3O60504 671 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 RCN2Q14257 317 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 CCDC6Q16204 474 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 C1orf186Q6ZWK4 172 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 ZFAND2BQ8WV99 257 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 SETDB2Q96T68 719 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 FAM118BQ9BPY3 351 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 NYXQ9GZU5 481 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 ZFP69BQ9UJL9 534 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 NUMBLQ9Y6R0 609 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 GZMAP12544 262 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 VHLP40337 213 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 CDR2Q01850 454 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 DDB1Q16531 1140 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 PDK4Q16654 411 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 SNX30Q5VWJ9 437 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 DSTYKQ6XUX3 929 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 CCDC125Q86Z20 511 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 C4orf33Q8N1A6 199 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 LRCH1Q9Y2L9 728 aa20.17■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 LMNAP02545 664 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 CYP1A2P05177 515 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 POLE2P56282 527 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 FOXB2Q5VYV0 432 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 TPH2Q8IWU9 490 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 NRG4Q8WWG1 115 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 KIFAP3Q92845 792 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 IFT43Q96FT9 208 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 FAM20AQ96MK3 541 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 SCOCQ9UIL1 159 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 MROH7Q68CQ1 1323 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 FAM196BA6NMK8 535 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 CYP26A1O43174 497 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 MUTP22033 750 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 GCAP28676 217 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 GCLMP48507 274 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 PPP3CAQ08209 521 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 AP3B2Q13367 1082 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 RCN1Q15293 331 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 RGS9BPQ6ZS82 235 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 GRK7Q8WTQ7 553 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 SLC5A5Q92911 643 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 TRIM4Q9C037 500 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 DCLK3Q9C098 648 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 TRABDQ9H4I3 376 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 TLE6Q9H808 572 aa20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 SLC5A9Q2M3M2 681 aa20.15■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 NLRP9Q7RTR0 991 aa20.15■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa20.15■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.15■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 UBN1Q9NPG3 1134 aa20.15■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 GTF3C4Q9UKN8 822 aa20.15■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 ECE2O60344 883 aa20.15■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 FGFR1P11362 822 aa20.15■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 MAN1A1P33908 653 aa20.15■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 FMO1Q01740 532 aa20.15■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.15■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 ODR4Q5SWX8 454 aa20.15■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 OTOAQ7RTW8 1153 aa20.15■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 SYCP3Q8IZU3 236 aa20.15■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 LINC00116Q8NCU8 138 aa20.15■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.827e-8■□□□□ 10.7
ACSS3-201ENST00000261206 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.15■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 NPHS2Q9NP85 383 aa20.15■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 PCNTO95613 3336 aa20.15■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa20.14■□□□□ 0.82
ACSS3-201ENST00000261206 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms