RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 HSPA1LP34931 641 aa6.7□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 RGS2P41220 211 aa6.7□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PSMC4P43686 418 aa6.7□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PDE1BQ01064 536 aa6.7□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 MTMR2Q13614 643 aa6.7□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TMEM270Q6UE05 265 aa6.7□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 WDR49Q8IV35 697 aa6.7□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 CTAGE3PQ8IX95 158 aa6.7□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TC2NQ8N9U0 490 aa6.7□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 AIFM3Q96NN9 605 aa6.7□□□□□ -1.34
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SETX-201ENST00000224140 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa6.7□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.7□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 CEP120Q8N960 986 aa6.7□□□□□ -1.34
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SETX-201ENST00000224140 SERPINB12Q96P63 405 aa6.7□□□□□ -1.34
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SETX-201ENST00000224140 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa6.7□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.7□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 OGTO15294 1046 aa6.7□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PJA2O43164 708 aa6.7□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TM4SF1P30408 202 aa6.7□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ZBTB17Q13105 803 aa6.7□□□□□ -1.34
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SETX-201ENST00000224140 USP38Q8NB14 1042 aa6.7□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 NUF2Q9BZD4 464 aa6.7□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.7□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PAK5Q9P286 719 aa6.7□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 C5P01031 1676 aa6.7□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 MAGEB16A2A368 324 aa6.7□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TTC4O95801 387 aa6.7□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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SETX-201ENST00000224140 SLC5A5Q92911 643 aa6.7□□□□□ -1.34
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SETX-201ENST00000224140 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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SETX-201ENST00000224140 CYP2C18P33260 490 aa6.7□□□□□ -1.34
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SETX-201ENST00000224140 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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SETX-201ENST00000224140 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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SETX-201ENST00000224140 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TXNP10599 105 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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SETX-201ENST00000224140 TAF2Q6P1X5 1199 aa6.69□□□□□ -1.34
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SETX-201ENST00000224140 TRPC7Q9HCX4 862 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 WHRNQ9P202 907 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 FBXO21O94952 628 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 IFNA8P32881 189 aa6.69□□□□□ -1.34
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SETX-201ENST00000224140 HIF1AQ16665 826 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa6.69□□□□□ -1.34
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SETX-201ENST00000224140 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 APPL2Q8NEU8 664 aa6.69□□□□□ -1.34
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