RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 HERPUD2Q9BSE4 406 aa23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNK9Q9NPC2 374 aa23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 EXOC7Q9UPT5 735 aa23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 ATF2P15336 505 aa23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 PEX3P56589 373 aa23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 ATG4AQ8WYN0 398 aa23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 RXFP1Q9HBX9 757 aa23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 ARHGEF3Q9NR81 526 aa23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 RAB20Q9NX57 234 aa23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 ANAPC5Q9UJX4 755 aa23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A1B0GUA9 196 aa23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 THAP12O43422 761 aa23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 UNGP13051 313 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 GTF2H1P32780 548 aa23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 CENPCQ03188 943 aa23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 PTP4A2Q12974 167 aa23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 LLGL1Q15334 1064 aa23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD42Q8N9B4 389 aa23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 TAS1R2Q8TE23 839 aa23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 MAGEB18Q96M61 343 aa23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 GGT7Q9UJ14 662 aa23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 ACTL7BQ9Y614 415 aa23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 YWHABP31946 246 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 ACCSLQ4AC99 568 aa23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC127Q96BQ5 260 aa23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 MROH7Q68CQ1 1323 aa23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 SCP2P22307 547 aa23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 ASRGL1Q7L266 308 aa23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 MCOLN2Q8IZK6 566 aa23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 CYP4X1Q8N118 509 aa23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 MFSD14AQ96MC6 490 aa23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 TBX20Q9UMR3 447 aa23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa23.6■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 POTEJP0CG39 1038 aa23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 SPP2Q13103 211 aa23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 MAP4K3Q8IVH8 894 aa23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM212AQ96EL1 285 aa23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 FBXL18Q96ME1 805 aa23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 GPRC5CQ9NQ84 441 aa23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 EURLQ9NYK6 297 aa23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 COL20A1Q9P218 1284 aa23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 FEM1BQ9UK73 627 aa23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 GH1P01241 217 aa23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 MYBL1P10243 752 aa23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF43Q68DV7 783 aa23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 C4orf19Q8IY42 314 aa23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 FITM2Q8N6M3 262 aa23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 BBOF1Q8ND07 529 aa23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 KLHL29Q96CT2 875 aa23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 SAAL1Q96ER3 474 aa23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 IFT74Q96LB3 600 aa23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 CDH16O75309 829 aa23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 ADCY8P40145 1251 aa23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 TKFCQ3LXA3 575 aa23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 CGB2Q6NT52 195 aa23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 IL31RAQ8NI17 732 aa23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 AGAP11Q8TF27 550 aa23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 MIEF2Q96C03 454 aa23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 MLXIPLQ9NP71 852 aa23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 FOXO6A8MYZ6 492 aa23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 CETPP11597 493 aa23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 CNGA1P29973 690 aa23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 STX2P32856 288 aa23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 GCNT1Q02742 428 aa23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 ACVR2BQ13705 512 aa23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 GDAP1Q8TB36 358 aa23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 GRAMD1AQ96CP6 724 aa23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM7Q9C029 511 aa23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
HTATSF1-201ENST00000218364 STAT4Q14765 748 aa23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 CRYMQ14894 314 aa23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM11Q96F44 468 aa23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
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