RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W YAR066WP0CX18 203 aa2.45□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W YHR214WP0CX19 203 aa2.45□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W STP22P25604 385 aa2.45□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W TFC1P32367 649 aa2.45□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W MRP21P38175 177 aa2.45□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W MIC19P43594 170 aa2.45□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W ATG18P43601 500 aa2.45□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W YGL159WP53110 370 aa2.45□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data2.45□□□□□ -2.02not detected
SIN3YOL004W RCF2P53721 224 aa2.45□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W FRE4P53746 719 aa2.45□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W ECM11Q04110 302 aa2.45□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W PEX12Q04370 399 aa2.45□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W STE23Q06010 1027 aa2.45□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W YPS3Q12303 508 aa2.45□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W RAS1P01119 309 aa2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W HEM15P16622 393 aa2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W ACH1P32316 526 aa2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W SUI1P32911 108 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W CUE1P38428 203 aa2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W BAP3P41815 604 aa2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W AIM24P47127 394 aa2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W HMS2P47175 358 aa2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W KTR5P53966 522 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W RSC9Q03124 581 aa2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W ARG80P07249 177 aa2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W NUP2P32499 720 aa2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W SOP4P39543 234 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W PCI8P40512 444 aa2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W STE24P47154 453 aa2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W IDP3P53982 420 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W ACT1P60010 375 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W NNT1Q05874 261 aa2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W YNG1Q08465 219 aa2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W MMT2Q08970 484 aa2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W YOR029WQ12243 111 aa2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W PAA1Q12447 191 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W SGA1P08019 549 aa2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W ZRT1P32804 376 aa2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W TAD2P47058 250 aa2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W UBC11P52492 156 aa2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W GTR2P53290 341 aa2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W ERV29P53337 310 aa2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W STD1Q02794 444 aa2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W BET5Q03630 159 aa2.44□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W RPL28P02406 149 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W DSF1P0CX08 502 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W YNR073CP0CX09 502 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W PTR2P32901 601 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W ANR2P36090 516 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W CAF4P36130 643 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W MRPL10P36520 322 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W LCP5P40079 357 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W GPI1P53306 609 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W HPT1Q04178 221 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W EMP46Q12396 444 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W HTB1P02293 131 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W HTB2P02294 131 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W MPC2P38857 129 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W YIL054WP40524 105 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W APQ12P40532 138 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W HAM1P47119 197 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W PAC10P48363 199 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W CWC25P53854 179 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W IZH1Q03419 316 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W VPS71Q03433 280 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W SSK1Q07084 712 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W YDL176WQ12027 708 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W FRE8Q12209 686 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W ICT1Q12385 394 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W PEP4P07267 405 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W CDC43P18898 376 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W FUN19P28003 413 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W AEP1P32493 518 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W CBT1P36038 271 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W SMF2P38778 549 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W MRH4P53166 561 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W TIM21P53220 239 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W SLX9P53251 210 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W YLR224WQ05947 369 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W LIP2Q06005 328 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W POM33Q12164 279 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W YPR011CQ12251 326 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W URA2P07259 2214 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W YCR087C-AP37263 153 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W BIG1P38813 335 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W YHR122WP38829 231 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W LSM1P47017 172 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W YJL016WP47072 561 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W SLD7Q08457 257 aa2.43□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W THP2O13539 261 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W CDC8P00572 216 aa2.42□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W MATALPHA1P0CY06 175 aa2.42□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W HMLALPHA1P0CY07 175 aa2.42□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W ANS1P38832 159 aa2.42□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W YPL077CQ02831 240 aa2.42□□□□□ -2.02
SIN3YOL004W YDR387CQ04162 555 aa2.42□□□□□ -2.02
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