RNA–Protein interactions for RNA: YLR363C

NMD4, Transcript of Protein that may be involved in nonsense-mediated mRNA decay, yeast

Gene NMD4, Length 657 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NMD4	YLR363C	SSO2	P39926	295 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	RPN14	P53196	417 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	MET31	Q03081	177 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	BNA7	Q04066	261 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	URC2	Q04411	772 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	SPO77	Q06134	477 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	UAF30	Q08747	228 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	AEP3	Q12089	606 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	NCA2	Q12374	616 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	HMS1	Q12398	434 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	ATG15	P25641	520 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	ATG7	P38862	630 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	YER184C	P39961	794 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	PMT4	P46971	762 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	GTO1	P48239	356 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	PHB2	P50085	310 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	OKP1	P53298	406 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	TVP15	Q03860	143 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	YDR124W	Q04608	324 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	GMC2	Q06201	188 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	NDE2	Q07500	545 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	YLL007C	Q07799	665 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	YPR096C	O13587	100 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	DST1	P07273	309 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	RPB5	P20434	215 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	YCL042W	P25572	119 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	PBN1	P25580	416 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	CHK1	P38147	527 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	VMA7	P39111	118 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	ECO1	P43605	281 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	MNT4	P53745	580 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	YLR460C	P54007	376 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	YDR541C	Q03049	344 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	SPC19	Q03954	165 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	YLR446W	Q06204	433 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	YAK1	P14680	807 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	GPI12	P23797	304 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	SOK1	P40317	901 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	GTT1	P40582	234 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	SFH5	P47008	294 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	COS1	P53822	381 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	YMR010W	Q03687	405 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	YDR286C	Q05530	114 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	SRL2	Q12020	392 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	ISN1	Q99312	450 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	SAS5	Q99314	248 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	TFC1	P32367	649 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.03	□□□□□ -1.76	not detected
NMD4	YLR363C	GOS1	P38736	223 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	TRM5	P38793	499 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	AYR1	P40471	297 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	MNN5	P46982	586 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	RMR1	P53060	241 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	YDR249C	Q03787	373 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	DCR2	Q05924	578 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	YLR413W	Q06689	675 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	YOR214C	Q12282	236 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	DCN1	Q12395	269 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	MTR10	Q99189	972 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NMD4	YLR363C	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
NMD4	YLR363C	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
NMD4	YLR363C	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NMD4	YLR363C	CMK2	P22517	447 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NMD4	YLR363C	YCR101C	P25607	182 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NMD4	YLR363C	YBR032W	P38223	100 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NMD4	YLR363C	YDR089W	P38966	869 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NMD4	YLR363C	PCL7	P40186	285 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NMD4	YLR363C	SLM1	P40485	686 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NMD4	YLR363C	RPE1	P46969	238 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NMD4	YLR363C	CCC1	P47818	322 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NMD4	YLR363C	TAF6	P53040	516 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NMD4	YLR363C	MTQ1	P53944	314 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NMD4	YLR363C	YMR279C	Q03263	540 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NMD4	YLR363C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NMD4	YLR363C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
NMD4	YLR363C	FEX1	Q08913	375 aa		4.02	□□□□□ -1.77

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