RNA–Protein interactions for RNA: YFR027W

ECO1, Transcript of Acetyltransferase, yeast

Gene ECO1, Length 846 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECO1	YFR027W	YPL067C	Q02754	198 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	ATG21	Q02887	496 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YMR155W	Q03795	547 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YDR391C	Q04170	232 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YLR446W	Q06204	433 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	SKG3	Q06315	1026 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	CNL1	Q06333	122 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	CUR1	Q06469	252 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	IPK1	Q06667	281 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YLR036C	Q07986	203 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	PAU23	Q07987	124 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	GEP3	Q08622	556 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	RDR1	Q08904	546 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	PAU17	Q12370	124 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	PUT1	P09368	476 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YOL163W	P0CF20	169 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	ANB1	P19211	157 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	RPB5	P20434	215 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	SGF29	P25554	259 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YCR099C	P25657	155 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	ADE1	P27616	306 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	SEC17	P32602	292 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	TIP20	P33891	701 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YBL029W	P38201	376 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	ARP1	P38696	384 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YHL044W	P38727	235 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YHL041W	P38730	149 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YEL057C	P39983	233 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	JHD1	P40034	492 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	AVT7	P40501	490 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	SYS1	P41544	203 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	PTR3	P43606	678 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	HMS2	P47175	358 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	OST3	P48439	350 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	MGA1	P53050	456 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YGL114W	P53134	725 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	PRM8	P53174	237 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YGR079W	P53249	370 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	GTR2	P53290	341 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	AAH1	P53909	347 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	DIA1	P54005	336 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	ELC1	Q03071	99 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	VBA1	Q04301	562 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	GMC1	Q04399	608 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	AVO2	Q04749	426 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	ROY1	Q04847	553 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	MRPL35	Q06678	367 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YDL057W	Q07379	328 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	HEM25	Q07534	307 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	THP1	Q08231	455 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	NUS1	Q12063	375 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YLR118C	Q12354	227 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	EAF3	Q12432	401 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YIL177C	P40434	1758 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YJL225C	P40889	1758 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	QCR7	P00128	127 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	COX2	P00410	251 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	MSW1	P04803	379 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	GAL7	P08431	366 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	PAU19	P0CE85	124 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	PAU21	P0CE86	164 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	PAU22	P0CE87	164 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YML003W	P0CF16	290 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	TIR1	P10863	254 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	TFS1	P14306	219 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	APE1	P14904	514 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	PRE8	P23639	250 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	STP22	P25604	385 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	PAU3	P25610	124 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	COT1	P32798	439 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	ASK1	P35734	292 aa		3.05	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.5 ms