RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616702.1

CCL3L3-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 2

Gene CCL3L3, Length 548 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-202ENST00000616702 CLIC4Q9Y696 253 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 TEX28O15482 410 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 KRT18P05783 430 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 ADH1AP07327 375 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 MYBP10242 640 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 HARSP12081 509 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 MTHFRP42898 656 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 DSG1Q02413 1049 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 GLRA4Q5JXX5 417 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 FAM173BQ6P4H8 233 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 CEP57Q86XR8 500 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 SPIRE2Q8WWL2 714 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 CDT1Q9H211 546 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 POMKQ9H5K3 350 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 CHST7Q9NS84 486 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 NR2E1Q9Y466 385 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 PRR33A8MZF0 331 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 SLC26A4O43511 780 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 KIF4AO95239 1232 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 RESTQ13127 1097 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 SPECC1Q5M775 1068 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 TAS1R3Q7RTX0 852 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 GPBP1Q86WP2 473 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 PALB2Q86YC2 1186 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 GLYCTKQ8IVS8 523 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 CEP120Q8N960 986 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 ZHX3Q9H4I2 956 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 SFXN1Q9H9B4 322 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 PTPRHQ9HD43 1115 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 MAN1C1Q9NR34 630 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 DPP7Q9UHL4 492 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 FAM13AO94988 1023 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 EFEMP2O95967 443 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 GLUD1P00367 558 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 MCF2P10911 925 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 PLCG1P19174 1290 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 GRM5P41594 1212 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 MCM6Q14566 821 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 ARSHQ5FYA8 562 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 FAM171A1Q5VUB5 890 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 MPZL3Q6UWV2 235 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 MYCT1Q8N699 235 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 BICD1Q96G01 975 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 ACAP3Q96P50 834 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 REEP2Q9BRK0 252 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 RXFP1Q9HBX9 757 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa14.91□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa14.9□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 H0YCG3 227 aa14.9□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 STX6O43752 255 aa14.9□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 TOM1L1O75674 476 aa14.9□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 B3GAT3O94766 335 aa14.9□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 SPATA31D3P0C874 917 aa14.9□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 MAPTP10636 758 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 RPL17P18621 184 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 CLCNKBP51801 687 aa14.9□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 NAB2Q15742 525 aa14.9□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa14.9□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 GPR149Q86SP6 731 aa14.9□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 RAD54LQ92698 747 aa14.9□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 EDAQ92838 391 aa14.9□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 EPSTI1Q96J88 318 aa14.9□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 TTPALQ9BTX7 342 aa14.9□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa14.9□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 CCDC39Q9UFE4 941 aa14.9□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 ODF2LQ9ULJ1 636 aa14.9□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 MTMR6Q9Y217 621 aa14.9□□□□□ -0.02
CCL3L3-202ENST00000616702 C2CD4DB7Z1M9 353 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL3L3-202ENST00000616702 CLDN3O15551 220 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL3L3-202ENST00000616702 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CCL3L3-202ENST00000616702 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CCL3L3-202ENST00000616702 PROZP22891 400 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL3L3-202ENST00000616702 DDIT3P35638 169 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL3L3-202ENST00000616702 TXLNAP40222 546 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL3L3-202ENST00000616702 CREMQ03060 361 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL3L3-202ENST00000616702 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CCL3L3-202ENST00000616702 PTPAQ15257 358 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL3L3-202ENST00000616702 SEZ6Q53EL9 994 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL3L3-202ENST00000616702 RTP2Q5QGT7 225 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL3L3-202ENST00000616702 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL3L3-202ENST00000616702 ZPBP2Q6X784 338 aa14.89□□□□□ -0.03
CCL3L3-202ENST00000616702 HAUS6Q7Z4H7 955 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms