RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 STXBP2Q15833 593 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 WLSQ5T9L3 541 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC149Q6ZUS6 474 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ASNSD1Q9NWL6 643 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 GNAT1P11488 350 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ARHGDIBP52566 201 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 MFSD14BQ5SR56 506 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 KIFC1Q9BW19 673 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ATPIF1Q9UII2 106 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CEP170Q5SW79 1584 aa7.34□□□□□ -1.23
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PTPRT-209ENST00000612229 RIN3Q8TB24 985 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 PI4K2BQ8TCG2 481 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 EME1Q96AY2 570 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 IP6K2Q9UHH9 426 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 FAM47DPA6NHR8 397 aa7.34□□□□□ -1.23
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PTPRT-209ENST00000612229 MDM1Q8TC05 714 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ACSBG1Q96GR2 724 aa7.34□□□□□ -1.23
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PTPRT-209ENST00000612229 CD209Q9NNX6 404 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 COX16Q9P0S2 106 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 SPACA6W5XKT8 324 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 BCORL1Q5H9F3 1711 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CCND2P30279 289 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 BNC1Q01954 994 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ADCK5Q3MIX3 580 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 NFRKBQ6P4R8 1299 aa7.34□□□□□ -1.23
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PTPRT-209ENST00000612229 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 GNPATO15228 680 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 SPAG6O75602 509 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM49P0CI25 452 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM49CP0CI26 452 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 DENND6AQ8IWF6 608 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 CALML6Q8TD86 181 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 KLHL20Q9Y2M5 609 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-209ENST00000612229 PREX2Q70Z35 1606 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 GOLGA8SH3BPF8 625 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
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PTPRT-209ENST00000612229 APBB2Q92870 758 aa7.34□□□□□ -1.24
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PTPRT-209ENST00000612229 ATP1A3P13637 1013 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 POLA2Q14181 598 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 HAVCR1Q96D42 359 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC17Q96LX7 622 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 MAGEA13PA6NCF6 341 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 POTEMA6NI47 508 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 RNF103O00237 685 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 FCGR1AP12314 374 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 POTEHQ6S545 545 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 POTEGQ6S5H5 508 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTPRT-209ENST00000612229 DPP10Q8N608 796 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SPATA4Q8NEY3 305 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC4Q9HBW1 653 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CDH16O75309 829 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SNAPC5O75971 98 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTPRT-209ENST00000612229 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
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PTPRT-209ENST00000612229 CCT7Q99832 543 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TRABDQ9H4I3 376 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SNX24Q9Y343 169 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TM9SF1O15321 606 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 RGS2P41220 211 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CYFIP2Q96F07 1278 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ADGRG1Q9Y653 693 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ITIH6Q6UXX5 1313 aa7.33□□□□□ -1.24
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