RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-211	ENST00000582232	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	CXCL8	P10145	99 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	EPHB4	P54760	987 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	OSTN	P61366	133 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	TPM4	P67936	248 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	BFSP1	Q12934	665 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	RASIP1	Q5U651	963 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	USP37	Q86T82	979 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	RDH13	Q8NBN7	331 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	TOP1MT	Q969P6	601 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	SNX27	Q96L92	541 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	12.5	□□□□□ -0.41	2e-8	■■■■■ 26.9
GGA3-211	ENST00000582232	RBSN	Q9H1K0	784 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	CNTN3	Q9P232	1028 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	DERA	Q9Y315	318 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	PTPRS	Q13332	1948 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	LACTBL1	A8MY62	500 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	KCNJ18	B7U540	433 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	HOXA2	O43364	376 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	AMH	P03971	560 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	KRT13	P13646	458 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	KCNE1	P15382	129 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	AKAP5	P24588	427 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	VAMP7	P51809	220 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	KCNJ12	Q14500	433 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	UVSSA	Q2YD98	709 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	RSAD1	Q9HA92	442 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	RNF19A	Q9NV58	838 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	PARP2	Q9UGN5	583 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	C2CD2	Q9Y426	696 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	ARL5C	A6NH57	179 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	PMM2	O15305	246 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	OFD1	O75665	1012 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	GTF2H1	P32780	548 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	AP3M2	P53677	418 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	WNT7B	P56706	349 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	ZBTB6	Q15916	424 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	MAN2A1	Q16706	1144 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	WDR49	Q8IV35	697 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	RNF214	Q8ND24	703 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	LPP	Q93052	612 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	SLC35C1	Q96A29	364 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	FNBP1	Q96RU3	617 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	CGRRF1	Q99675	332 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	GDF15	Q99988	308 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	APOL6	Q9BWW8	343 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	PTGES	O14684	152 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	STX10	O60499	249 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	DGKI	O75912	1065 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	ATP1A3	P13637	1013 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	CYP3A5	P20815	502 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	KCNJ6	P48051	423 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	DLG4	P78352	724 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	DEFB103A	P81534	67 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	KRT31	Q15323	416 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	JADE1	Q6IE81	842 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	GAD1	Q99259	594 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	INTS13	Q9NVM9	706 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	PTPRJ	Q12913	1337 aa		12.46	□□□□□ -0.41
GGA3-211	ENST00000582232	COL4A6	Q14031	1691 aa		12.46	□□□□□ -0.41

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