RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 COBLL1Q53SF7 1204 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 ANKRD40Q6AI12 368 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 KLHL10Q6JEL2 608 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 TAF2Q6P1X5 1199 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC65Q8IXS2 484 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 C7orf61Q8IZ16 206 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 TIPINQ9BVW5 301 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 NFKBIZQ9BYH8 718 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 PDZD7Q9H5P4 517 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 RNF19AQ9NV58 838 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 TRPV2Q9Y5S1 764 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 PTPRJQ12913 1337 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 KIAA0355O15063 1070 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 CLIC2O15247 247 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 B4GALT3O60512 393 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 PIGRP01833 764 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 PRKCBP05771 671 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 SYN1P17600 705 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 TNFSF9P41273 254 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 WDR4P57081 412 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 AMPD3Q01432 767 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 FAM187BQ17R55 369 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 CENPPQ6IPU0 288 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 LRSAM1Q6UWE0 723 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 LRRC8DQ7L1W4 858 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 TCP11Q8WWU5 503 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 NELFBQ8WX92 580 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 MAP7D2Q96T17 732 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 HINFPQ9BQA5 517 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 RBSNQ9H1K0 784 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 HIPK3Q9H422 1215 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 C17orf75Q9HAS0 396 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 SEL1LQ9UBV2 794 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 PADI3Q9ULW8 664 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 C5orf42Q9H799 3197 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 XIRP2A4UGR9 3374 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 SMC2O95347 1197 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 CXCL10P02778 98 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 ACRP10323 421 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 GNAT1P11488 350 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 CSF2RAP15509 400 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 SELPP16109 830 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 PHKA2P46019 1235 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 GDF10P55107 478 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 POU5F1BQ06416 359 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 STX1AQ16623 288 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 PTPN21Q16825 1174 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 C1orf220Q5T0J3 134 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF410Q86VK4 478 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 MYOCDQ8IZQ8 938 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 CRIPAKQ8N1N5 446 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 TRIML1Q8N9V2 468 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 DEPTORQ8TB45 409 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 P2RX5Q93086 422 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 ITPKCQ96DU7 683 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 SAAL1Q96ER3 474 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 BORCS6Q96GS4 357 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 CDT1Q9H211 546 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 CBX8Q9HC52 389 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 DMAC2Q9NW81 257 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 HES2Q9Y543 173 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 STYXL1Q9Y6J8 313 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 PTPRDP23468 1912 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 A0A0B4J269 797 aa9.08□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 A0A1B0GUA9 196 aa9.08□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 GOLGA8IPA6NC78 632 aa9.08□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 GOLGA8JA6NMD2 632 aa9.08□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM229AB2RXF0 380 aa9.08□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 ACKR2O00590 384 aa9.08□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 LRRN2O75325 713 aa9.08□□□□□ -0.96
TMOD3-211ENST00000561438 ADH1AP07327 375 aa9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms