RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556705.5

SRP54-AS1-204, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP54-AS1, Length 580 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CHST7Q9NS84 486 aa14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CCDC39Q9UFE4 941 aa14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CDH22Q9UJ99 828 aa14.51□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 A0A087X0B3 334 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TADA2AO75478 443 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TOM1L1O75674 476 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 BRD1O95696 1058 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 URODP06132 367 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 HARSP12081 509 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CLCN4P51793 760 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DSG1Q02413 1049 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 STK38Q15208 465 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TPRNQ4KMQ1 711 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SEZ6Q53EL9 994 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 XKR4Q5GH76 650 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RRAGBQ5VZM2 374 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 HASPINQ8TF76 798 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FIZ1Q96SL8 496 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 HAPLN2Q9GZV7 340 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZHX3Q9H4I2 956 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PARVGQ9HBI0 331 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RXFP1Q9HBX9 757 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 STK17AQ9UEE5 414 aa14.5□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TCHHQ07283 1943 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PI4K2BG5E9Z4 385 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TEX28O15482 410 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TRAK2O60296 914 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 KIF4AO95239 1232 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 WEE2P0C1S8 567 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NMT1P30419 496 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 YARSP54577 528 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PKP1Q13835 747 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 USP41Q3LFD5 358 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 KIAA1841Q6NSI8 718 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZPBP2Q6X784 338 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DYMQ7RTS9 669 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PPFIBP1Q86W92 1011 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 KCNN1Q92952 543 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ACAP3Q96P50 834 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ADAM7Q9H2U9 754 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TBX20Q9UMR3 447 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DOCK6Q96HP0 2047 aa14.49□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ANK1P16157 1881 aa14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MYMKA6NI61 221 aa14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LOC730098B7Z3J9 87 aa14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 H0YCG3 227 aa14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 K7ENM7 598 aa14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SPTLC2O15270 562 aa14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 F13A1P00488 732 aa14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TXLNAP40222 546 aa14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CLCNKBP51801 687 aa14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MCL1Q07820 350 aa14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CD300LGQ6UXG3 332 aa14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SV2BQ7L1I2 683 aa14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DDX12PQ92771 950 aa14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 BICD1Q96G01 975 aa14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SNX27Q96L92 541 aa14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FBXL18Q96ME1 805 aa14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DZANK1Q9NVP4 752 aa14.48□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DENND4AQ7Z401 1863 aa14.47□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CLDN3O15551 220 aa14.47□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PPP6R2O75170 966 aa14.47□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 YEATS4O95619 227 aa14.47□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PIGRP01833 764 aa14.47□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ADH1AP07327 375 aa14.47□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 KCNE1P15382 129 aa14.47□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RPL17P18621 184 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 GTF2BQ00403 316 aa14.47□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ITIH3Q06033 890 aa14.47□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SLC10A6Q3KNW5 377 aa14.47□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RTP2Q5QGT7 225 aa14.47□□□□□ -0.09
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FAM171A1Q5VUB5 890 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms