RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553025.5

ANKRD13A-208, Transcript of ankyrin repeat domain 13A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ANKRD13A, Length 1,455 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD13A-208ENST00000553025 BRSK2Q8IWQ3 736 aa11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 CRIPAKQ8N1N5 446 aa11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 TET1Q8NFU7 2136 aa11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 PLEKHO2Q8TD55 490 aa11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 BADQ92934 168 aa11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 HES2Q9Y543 173 aa11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 LACTBL1A8MY62 500 aa11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 IL18RAPO95256 599 aa11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 KRT13P13646 458 aa11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 VAMP7P51809 220 aa11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 BFSP1Q12934 665 aa11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 KRT31Q15323 416 aa11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 SURF1Q15526 300 aa11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 C1orf220Q5T0J3 134 aa11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 CREBRFQ8IUR6 639 aa11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 CD302Q8IX05 232 aa11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 HACE1Q8IYU2 909 aa11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 SLC39A7Q92504 469 aa11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 PGBD4Q96DM1 585 aa11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 TSPAN18Q96SJ8 248 aa11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 ASB7Q9H672 318 aa11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 PDE11AQ9HCR9 933 aa11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 UBN1Q9NPG3 1134 aa11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 GIT1Q9Y2X7 761 aa11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 NR2E3Q9Y5X4 410 aa11.95□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 EFCAB14O75071 495 aa11.94□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 CXCL8P10145 99 aa11.94□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 C7P10643 843 aa11.94□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 ITGA4P13612 1032 aa11.94□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 AKAP5P24588 427 aa11.94□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 GTF2H1P32780 548 aa11.94□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 YARSP54577 528 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 WNT7BP56706 349 aa11.94□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 DLG4P78352 724 aa11.94□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 FANCCQ00597 558 aa11.94□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 FPGSQ05932 587 aa11.94□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 PPP2R3AQ06190 1150 aa11.94□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 MAN2A1Q16706 1144 aa11.94□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 MIIPQ5JXC2 388 aa11.94□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 AGMOQ6ZNB7 445 aa11.94□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 USP37Q86T82 979 aa11.94□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa11.94□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 SLC35C1Q96A29 364 aa11.94□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 CCDC127Q96BQ5 260 aa11.94□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP11.94□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 PMM2O15305 246 aa11.93□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 AP5Z1O43299 807 aa11.93□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 RECQL4O94761 1208 aa11.93□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 FGBP02675 491 aa11.93□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 ACRP10323 421 aa11.93□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 KCNE1P15382 129 aa11.93□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 SYN1P17600 705 aa11.93□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 RGS19P49795 217 aa11.93□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 COPB1P53618 953 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 KCNH2Q12809 1159 aa11.93□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 NR1I3Q14994 352 aa11.93□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 ZBTB6Q15916 424 aa11.93□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 VWA3BQ502W6 1294 aa11.93□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 SARM1Q6SZW1 724 aa11.93□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 ZNF516Q92618 1163 aa11.93□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 SNX27Q96L92 541 aa11.93□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 GRPEL1Q9HAV7 217 aa11.93□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 TMEM161AQ9NX61 479 aa11.93□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 CNTN3Q9P232 1028 aa11.93□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 PARP2Q9UGN5 583 aa11.93□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 DERAQ9Y315 318 aa11.93□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 ALPK3Q96L96 1907 aa11.93□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 A0A1B0GTH6 734 aa11.92□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 MEIS3P2A8K0S8 358 aa11.92□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 INPPL1O15357 1258 aa11.92□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 STX10O60499 249 aa11.92□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 OFD1O75665 1012 aa11.92□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 BAIAP3O94812 1187 aa11.92□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 SERPINC1P01008 464 aa11.92□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 ACTN1P12814 892 aa11.92□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 AP3M2P53677 418 aa11.92□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 EPHB4P54760 987 aa11.92□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 PPP3CAQ08209 521 aa11.92□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 DUOXA2Q1HG44 320 aa11.92□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 TMEM240Q5SV17 173 aa11.92□□□□□ -0.5
ANKRD13A-208ENST00000553025 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP11.92□□□□□ -0.55e-10■■■■■ 38.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms