RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530756.1

BRMS1-208, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene BRMS1, Length 963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-208ENST00000530756 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa16.19■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 NOSTRINQ8IVI9 506 aa16.19■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 SLFN12Q8IYM2 578 aa16.19■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 NECAB1Q8N987 351 aa16.19■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 SLC7A14Q8TBB6 771 aa16.19■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 SEMA4AQ9H3S1 761 aa16.19■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 PCDHA12Q9UN75 941 aa16.19■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 MIA3Q5JRA6 1907 aa16.18■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 KANSL1LA0AUZ9 987 aa16.18■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 MED24O75448 989 aa16.18■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 RECQL4O94761 1208 aa16.18■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 TXKP42681 527 aa16.18■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 CALCRLQ16602 461 aa16.18■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 SLC5A9Q2M3M2 681 aa16.18■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 SLC44A4Q53GD3 710 aa16.18■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 PPM1LQ5SGD2 360 aa16.18■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.18■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 NPAS3Q8IXF0 933 aa16.18■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 RUBCNQ92622 972 aa16.18■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 MTMR9Q96QG7 549 aa16.18■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 POLIQ9UNA4 740 aa16.18■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 EPG5Q9HCE0 2579 aa16.18■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa16.17■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 BTBD18B2RXH4 712 aa16.17■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 I3L4J1 428 aa16.17■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 BAG4O95429 457 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 OR1D2P34982 312 aa16.17■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 FZD5Q13467 585 aa16.17■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 GLRA4Q5JXX5 417 aa16.17■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 TSSK4Q6SA08 328 aa16.17■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa16.17■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 C3orf58Q8NDZ4 430 aa16.17■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 HINFPQ9BQA5 517 aa16.17■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 KIFC3Q9BVG8 833 aa16.17■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 CCDC113Q9H0I3 377 aa16.17■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa16.17■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 DLL3Q9NYJ7 618 aa16.17■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 SPTBN2O15020 2390 aa16.16■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 FAM170BA6NMN3 283 aa16.16■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP16.16■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 FGFR3P22607 806 aa16.16■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 TARSP26639 723 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 KRT2P35908 639 aa16.16■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 CREMQ03060 361 aa16.16■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 UBXN2BQ14CS0 331 aa16.16■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 FAM187BQ17R55 369 aa16.16■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 LIN9Q5TKA1 542 aa16.16■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 CATSPER3Q86XQ3 398 aa16.16■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 HACE1Q8IYU2 909 aa16.16■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 LTB4R2Q9NPC1 389 aa16.16■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 GDAQ9Y2T3 454 aa16.16■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 JAK2O60674 1132 aa16.15■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 CDKL5O76039 1030 aa16.15■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 THP07101 528 aa16.15■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 LIG1P18858 919 aa16.15■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 TKTP29401 623 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 BRCC3P46736 316 aa16.15■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 RAB33AQ14088 237 aa16.15■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 CEP120Q8N960 986 aa16.15■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 MCRS1Q96EZ8 462 aa16.15■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 MTRRQ9UBK8 725 aa16.15■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 CDY1Q9Y6F8 540 aa16.15■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
BRMS1-208ENST00000530756 NEMFO60524 1076 aa16.14■□□□□ 0.17
BRMS1-208ENST00000530756 PRKCBP05771 671 aa16.14■□□□□ 0.17
BRMS1-208ENST00000530756 CEBPBP17676 345 aa16.14■□□□□ 0.17
BRMS1-208ENST00000530756 HOXA9P31269 272 aa16.14■□□□□ 0.17
BRMS1-208ENST00000530756 CLCNKBP51801 687 aa16.14■□□□□ 0.17
BRMS1-208ENST00000530756 ST3GAL1Q11201 340 aa16.14■□□□□ 0.17
BRMS1-208ENST00000530756 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP16.14■□□□□ 0.17
BRMS1-208ENST00000530756 ECM1Q16610 540 aa16.14■□□□□ 0.17
BRMS1-208ENST00000530756 ME3Q16798 604 aa16.14■□□□□ 0.17
BRMS1-208ENST00000530756 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
BRMS1-208ENST00000530756 NT5DC1Q5TFE4 455 aa16.14■□□□□ 0.17
BRMS1-208ENST00000530756 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
BRMS1-208ENST00000530756 TPRG1Q6ZUI0 275 aa16.14■□□□□ 0.17
BRMS1-208ENST00000530756 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
BRMS1-208ENST00000530756 TMEM130Q8N3G9 435 aa16.14■□□□□ 0.17
BRMS1-208ENST00000530756 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
BRMS1-208ENST00000530756 TCEAL4Q96EI5 215 aa16.14■□□□□ 0.17
BRMS1-208ENST00000530756 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
BRMS1-208ENST00000530756 PRIMPOLQ96LW4 560 aa16.14■□□□□ 0.17
BRMS1-208ENST00000530756 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
BRMS1-208ENST00000530756 HEBP1Q9NRV9 189 aa16.14■□□□□ 0.17
BRMS1-208ENST00000530756 N4BP3O15049 544 aa16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms