RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP5.71□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 C7orf25Q9BPX7 421 aa5.71□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 PCDH12Q9NPG4 1184 aa5.71□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
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CPEB4-210ENST00000522344 SIK3Q9Y2K2 1263 aa5.71□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 MRFAP1Q9Y605 127 aa5.71□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 ACTL7AQ9Y615 435 aa5.71□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 ALG1L2C9J202 215 aa5.7□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF185O15231 689 aa5.7□□□□□ -1.5
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CPEB4-210ENST00000522344 NCR1O76036 304 aa5.7□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 LAG3P18627 525 aa5.7□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 ATP5JP18859 108 aa5.7□□□□□ -1.5
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CPEB4-210ENST00000522344 TGFB2P61812 414 aa5.7□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP5.7□□□□□ -1.5
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CPEB4-210ENST00000522344 RAB24Q969Q5 203 aa5.7□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP5.7□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 TEX101Q9BY14 249 aa5.7□□□□□ -1.5
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CPEB4-210ENST00000522344 ATRNL1Q5VV63 1379 aa5.69□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 SHTN1A0MZ66 631 aa5.69□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 DRGXA6NNA5 263 aa5.69□□□□□ -1.5
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CPEB4-210ENST00000522344 PCDHGA12O60330 932 aa5.69□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 GPR32O75388 356 aa5.69□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 NDUFA10O95299 355 aa5.69□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 ABHD16AO95870 558 aa5.69□□□□□ -1.5
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CPEB4-210ENST00000522344 C5AR1P21730 350 aa5.69□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 CCND1P24385 295 aa5.69□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 GUCY1A2P33402 732 aa5.69□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 SLC16A1P53985 500 aa5.69□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 PTPN21Q16825 1174 aa5.69□□□□□ -1.5
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CPEB4-210ENST00000522344 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa5.69□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF627Q7L945 461 aa5.69□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 MYOCQ99972 504 aa5.69□□□□□ -1.5
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CPEB4-210ENST00000522344 SLC46A2Q9BY10 475 aa5.69□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 AKIP1Q9NQ31 210 aa5.69□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 TUBD1Q9UJT1 453 aa5.69□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 FZD1Q9UP38 647 aa5.69□□□□□ -1.5
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CPEB4-210ENST00000522344 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa5.69□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa5.69□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa5.69□□□□□ -1.5
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CPEB4-210ENST00000522344 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa5.69□□□□□ -1.5
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CPEB4-210ENST00000522344 LPXNO60711 386 aa5.68□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 POMCP01189 267 aa5.68□□□□□ -1.5
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CPEB4-210ENST00000522344 PCSK1P29120 753 aa5.68□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 FSTL1Q12841 308 aa5.68□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 PTPAQ15257 358 aa5.68□□□□□ -1.5
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CPEB4-210ENST00000522344 TSHZ3Q63HK5 1081 aa5.68□□□□□ -1.5
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CPEB4-210ENST00000522344 MIGA2Q7L4E1 593 aa5.68□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa5.68□□□□□ -1.5
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CPEB4-210ENST00000522344 PLXDC1Q8IUK5 500 aa5.68□□□□□ -1.5
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CPEB4-210ENST00000522344 SSH1Q8WYL5 1049 aa5.68□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 CYFIP2Q96F07 1278 aa5.68□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa5.68□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa5.68□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 CHST2Q9Y4C5 530 aa5.68□□□□□ -1.5
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CPEB4-210ENST00000522344 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 DRC7Q8IY82 874 aa5.67□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa5.67□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 LENG9Q96B70 501 aa5.67□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 TEKT5Q96M29 485 aa5.67□□□□□ -1.5
CPEB4-210ENST00000522344 NEU1Q99519 415 aa5.67□□□□□ -1.5
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