RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521865.5

PABPC1-218, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, humanhuman

TSL 2

Gene PABPC1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1-218ENST00000521865 CCDC105Q8IYK2 499 aa22.96■■□□□ 1.27
PABPC1-218ENST00000521865 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.96■■□□□ 1.27
PABPC1-218ENST00000521865 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PABPC1-218ENST00000521865 KIFAP3Q92845 792 aa22.96■■□□□ 1.27
PABPC1-218ENST00000521865 CLSTN3Q9BQT9 956 aa22.96■■□□□ 1.27
PABPC1-218ENST00000521865 CXCL16Q9H2A7 254 aa22.96■■□□□ 1.27
PABPC1-218ENST00000521865 FBXW11Q9UKB1 542 aa22.96■■□□□ 1.27
PABPC1-218ENST00000521865 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.96■■□□□ 1.27
PABPC1-218ENST00000521865 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PABPC1-218ENST00000521865 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 EDN1P05305 212 aa22.95■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 C8AP07357 584 aa22.95■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 PLXNA3P51805 1871 aa22.95■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 NBR1Q14596 966 aa22.95■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 GLRA4Q5JXX5 417 aa22.95■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 DTWD2Q8NBA8 298 aa22.95■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.95■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 C2orf16Q68DN1 1984 aa22.94■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 KRBA1A5PL33 1030 aa22.94■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 PRR23AA6NEV1 266 aa22.94■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 CCDC169A6NNP5 214 aa22.94■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 K7ERI5 159 aa22.94■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 B3GAT3O94766 335 aa22.94■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 PAPLNO95428 1278 aa22.94■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 TRAPPC10P48553 1259 aa22.94■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 ANGPT1Q15389 498 aa22.94■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 ECM1Q16610 540 aa22.94■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 GPR152Q8TDT2 470 aa22.94■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 RAB34Q9BZG1 259 aa22.94■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 NUMBLQ9Y6R0 609 aa22.94■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 CCL16O15467 120 aa22.93■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 XYLBO75191 536 aa22.93■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 NTHL1P78549 312 aa22.93■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 NAB2Q15742 525 aa22.93■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.93■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.93■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 TBC1D17Q9HA65 648 aa22.93■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 STK24Q9Y6E0 443 aa22.93■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 ADAM12O43184 909 aa22.92■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 OR1D2P34982 312 aa22.92■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 YARSP54577 528 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 HTR4Q13639 388 aa22.92■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.92■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 ANHXE9PGG2 379 aa22.91■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 CLCNKBP51801 687 aa22.91■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 PEX3P56589 373 aa22.91■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 OSTNP61366 133 aa22.91■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 SPECC1Q5M775 1068 aa22.91■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.91■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.91■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 UROC1Q96N76 676 aa22.91■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 ARHGEF3Q9NR81 526 aa22.91■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 CDH7Q9ULB5 785 aa22.91■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 DNM3Q9UQ16 869 aa22.91■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 TRAPPC3O43617 180 aa22.9■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 HOXA9P31269 272 aa22.9■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 PTGDRQ13258 359 aa22.9■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 PDIA5Q14554 519 aa22.9■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.9■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 KRT79Q5XKE5 535 aa22.9■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.9■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22.9■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 CDY1Q9Y6F8 540 aa22.9■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.89■■□□□ 1.26
PABPC1-218ENST00000521865 E9PMD0 336 aa22.89■■□□□ 1.25
PABPC1-218ENST00000521865 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.89■■□□□ 1.25
PABPC1-218ENST00000521865 FGFR3P22607 806 aa22.89■■□□□ 1.25
PABPC1-218ENST00000521865 NPTX2P47972 431 aa22.89■■□□□ 1.25
PABPC1-218ENST00000521865 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PABPC1-218ENST00000521865 RAB33AQ14088 237 aa22.89■■□□□ 1.25
PABPC1-218ENST00000521865 PARM1Q6UWI2 310 aa22.89■■□□□ 1.25
PABPC1-218ENST00000521865 CEP120Q8N960 986 aa22.89■■□□□ 1.25
PABPC1-218ENST00000521865 FGF14Q92915 247 aa22.89■■□□□ 1.25
PABPC1-218ENST00000521865 TCHPQ9BT92 498 aa22.89■■□□□ 1.25
PABPC1-218ENST00000521865 MTRRQ9UBK8 725 aa22.89■■□□□ 1.25
PABPC1-218ENST00000521865 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.89■■□□□ 1.25
PABPC1-218ENST00000521865 MYO15AQ9UKN7 3530 aa22.89■■□□□ 1.25
PABPC1-218ENST00000521865 I3L4J1 428 aa22.88■■□□□ 1.25
PABPC1-218ENST00000521865 HIP1RO75146 1068 aa22.88■■□□□ 1.25
PABPC1-218ENST00000521865 DCNP07585 359 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PABPC1-218ENST00000521865 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PABPC1-218ENST00000521865 TKTP29401 623 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PABPC1-218ENST00000521865 BRCC3P46736 316 aa22.88■■□□□ 1.25
PABPC1-218ENST00000521865 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PABPC1-218ENST00000521865 UPP1Q16831 310 aa22.88■■□□□ 1.25
PABPC1-218ENST00000521865 UVSSAQ2YD98 709 aa22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms