RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		6.14	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	6.14	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	AFMID	Q63HM1	303 aa		6.14	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		6.14	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		6.14	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	ELANE	P08246	267 aa		6.13	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	6.13	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	SLC6A9	P48067	706 aa		6.13	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	MALL	Q13021	153 aa		6.13	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	TP53BP2	Q13625	1128 aa		6.13	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	SEPT2	Q15019	361 aa		6.13	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		6.13	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		6.13	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		6.13	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	COG1	Q8WTW3	980 aa		6.13	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		6.13	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		6.13	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		6.13	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		6.13	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	PIPSL	A2A3N6	862 aa		6.12	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057		K7ESF4	209 aa		6.12	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	SPDEF	O95238	335 aa		6.12	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	CFI	P05156	583 aa		6.12	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	SPATA31D3	P0C874	917 aa		6.12	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	FPR1	P21462	350 aa		6.12	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	TGM1	P22735	817 aa		6.12	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	ALDH1A3	P47895	512 aa		6.12	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	GUCY1B3	Q02153	619 aa		6.12	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	SCAP	Q12770	1279 aa		6.12	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	FAP	Q12884	760 aa		6.12	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		6.12	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		6.12	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		6.12	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	MRI1	Q9BV20	369 aa		6.12	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		6.12	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	LANCL2	Q9NS86	450 aa		6.12	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		6.12	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		6.12	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		6.12	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	OSM	P13725	252 aa		6.11	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	TYRP1	P17643	537 aa		6.11	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	RAP2B	P61225	183 aa		6.11	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	MGAT2	Q10469	447 aa		6.11	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	REST	Q13127	1097 aa		6.11	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	MED25	Q71SY5	747 aa		6.11	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	DRC7	Q8IY82	874 aa		6.11	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		6.11	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	STON2	Q8WXE9	905 aa		6.11	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	ASB10	Q8WXI3	467 aa		6.11	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		6.11	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	LDAH	Q9H6V9	325 aa		6.11	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		6.11	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC78	A2IDD5	438 aa		6.1	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	IL2RB	P14784	551 aa		6.1	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	PCSK1	P29120	753 aa		6.1	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	FOXI1	Q12951	378 aa		6.1	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	NOMO1	Q15155	1222 aa		6.1	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		6.1	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		6.1	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		6.1	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	COQ10A	Q96MF6	247 aa		6.1	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		6.1	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		6.1	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	PPFIA2	O75334	1257 aa		6.09	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	PRSS23	O95084	383 aa		6.09	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	HLA-DOA	P06340	250 aa		6.09	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	RAP2A	P10114	183 aa		6.09	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	CPE	P16870	476 aa		6.09	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	CNGA1	P29973	690 aa		6.09	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	SLC5A3	P53794	718 aa		6.09	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	SEC24C	P53992	1094 aa		6.09	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	USP14	P54578	494 aa		6.09	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	PER3	P56645	1201 aa		6.09	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	OCA2	Q04671	838 aa		6.09	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		6.09	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		6.09	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	LCORL	Q8N3X6	602 aa		6.09	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	6.09	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		6.09	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	6.09	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	MYOC	Q99972	504 aa		6.09	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	ADI1	Q9BV57	179 aa		6.09	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		6.09	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		6.09	□□□□□ -1.43
COPS5-208	ENST00000519057	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		6.09	□□□□□ -1.43

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