RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC44A3Q8N4M1 653 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 RSAD2Q8WXG1 361 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 MYADMQ96S97 322 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 CLSTN3Q9BQT9 956 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 KIFC3Q9BVG8 833 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 DENND4AQ7Z401 1863 aa21.19■□□□□ 0.98
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SH3BP2-220ENST00000511663 B3GAT3O94766 335 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 PAPLNO95428 1278 aa21.18■□□□□ 0.98
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SH3BP2-220ENST00000511663 EEF1DP3Q658K8 133 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 C4orf32Q8N8J7 132 aa21.18■□□□□ 0.98
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SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
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SH3BP2-220ENST00000511663 KCNG1Q9UIX4 513 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 POLIQ9UNA4 740 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 TNFSF13BQ9Y275 285 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIOO75962 3097 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 PLXNA3P51805 1871 aa21.18■□□□□ 0.98
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SH3BP2-220ENST00000511663 NT5DC1Q5TFE4 455 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 DTHD1Q6ZMT9 781 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 DRC1Q96MC2 740 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 TCHPQ9BT92 498 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 FBXW11Q9UKB1 542 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
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SH3BP2-220ENST00000511663 NPR3P17342 541 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 UVSSAQ2YD98 709 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 GLRA4Q5JXX5 417 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
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SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM134Q9H6X4 195 aa21.16■□□□□ 0.98
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SH3BP2-220ENST00000511663 SLC38A7Q9NVC3 462 aa21.16■□□□□ 0.98
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SH3BP2-220ENST00000511663 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
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SH3BP2-220ENST00000511663 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 C17orf75Q9HAS0 396 aa21.15■□□□□ 0.98
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SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa21.14■□□□□ 0.97
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SH3BP2-220ENST00000511663 HOXA9P31269 272 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2-220ENST00000511663 PRPHP41219 470 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2-220ENST00000511663 NBL1P41271 181 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2-220ENST00000511663 RAB33AQ14088 237 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2-220ENST00000511663 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF568Q3ZCX4 644 aa21.14■□□□□ 0.97
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SH3BP2-220ENST00000511663 RTL10Q7L3V2 364 aa21.14■□□□□ 0.97
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SH3BP2-220ENST00000511663 CXCL16Q9H2A7 254 aa21.14■□□□□ 0.97
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SH3BP2-220ENST00000511663 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa21.13■□□□□ 0.97
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SH3BP2-220ENST00000511663 SLC7A14Q8TBB6 771 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP2-220ENST00000511663 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
SH3BP2-220ENST00000511663 ACAP3Q96P50 834 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP2-220ENST00000511663 TIPINQ9BVW5 301 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP2-220ENST00000511663 NUMBLQ9Y6R0 609 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP2-220ENST00000511663 ANHXE9PGG2 379 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BP2-220ENST00000511663 ELF1P32519 619 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BP2-220ENST00000511663 SMTNP53814 917 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BP2-220ENST00000511663 ANGPT1Q15389 498 aa21.12■□□□□ 0.97
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