RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489824.1

RPS6KB1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase B1, humanhuman

TSL 3

Gene RPS6KB1, Length 909 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1-208ENST00000489824 SLC44A3Q8N4M1 653 aa21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 POLD4Q9HCU8 107 aa21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 WNT16Q9UBV4 365 aa21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 FBXW11Q9UKB1 542 aa21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 USP34Q70CQ2 3546 aa21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 C2orf16Q68DN1 1984 aa21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 PLXNA3P51805 1871 aa21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 CCDC169A6NNP5 214 aa21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 PAPLNO95428 1278 aa21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 SRFP11831 508 aa21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 LAMP2P13473 410 aa21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 YARSP54577 528 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 PDIA5Q14554 519 aa21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 NBR1Q14596 966 aa21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 ECM1Q16610 540 aa21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 CLSTN3Q9BQT9 956 aa21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 POLIQ9UNA4 740 aa21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 DNM3Q9UQ16 869 aa21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 PROB1E7EW31 1015 aa21.4■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 XYLBO75191 536 aa21.4■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 B3GAT3O94766 335 aa21.4■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 EDN1P05305 212 aa21.4■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 C8AP07357 584 aa21.4■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 NPR3P17342 541 aa21.4■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 PTGDRQ13258 359 aa21.4■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 GLRA4Q5JXX5 417 aa21.4■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 KRT79Q5XKE5 535 aa21.4■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 UROC1Q96N76 676 aa21.4■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 CA14Q9ULX7 337 aa21.4■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa21.39■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 TRAPPC3O43617 180 aa21.39■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 PI15O43692 258 aa21.39■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 NBL1P41271 181 aa21.39■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 PEX3P56589 373 aa21.39■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 NAB2Q15742 525 aa21.39■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 NT5DC1Q5TFE4 455 aa21.39■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa21.39■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 CCDC105Q8IYK2 499 aa21.39■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 C4orf32Q8N8J7 132 aa21.39■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 CXCL16Q9H2A7 254 aa21.39■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 TNFSF13BQ9Y275 285 aa21.39■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 KIF3AQ9Y496 699 aa21.39■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 LAD1O00515 517 aa21.38■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 CCL16O15467 120 aa21.38■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.017e-7■■■□□ 14.8
RPS6KB1-208ENST00000489824 HOXA9P31269 272 aa21.38■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZNF568Q3ZCX4 644 aa21.38■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 IGSF22Q8N9C0 903 aa21.38■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 DTWD2Q8NBA8 298 aa21.38■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 SLC7A14Q8TBB6 771 aa21.38■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 DRC1Q96MC2 740 aa21.38■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa21.38■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 NUMBLQ9Y6R0 609 aa21.38■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 ANHXE9PGG2 379 aa21.37■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa21.37■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 OR1D2P34982 312 aa21.37■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 NPTX2P47972 431 aa21.37■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 CLCNKBP51801 687 aa21.37■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 HTR4Q13639 388 aa21.37■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 DTHD1Q6ZMT9 781 aa21.37■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 FRMD5Q7Z6J6 570 aa21.37■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 GPR152Q8TDT2 470 aa21.37■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 TCHPQ9BT92 498 aa21.37■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 KMT5AQ9NQR1 393 aa21.37■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 SLC38A7Q9NVC3 462 aa21.37■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 CDH7Q9ULB5 785 aa21.37■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 KRBA1A5PL33 1030 aa21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 E9PMD0 336 aa21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 ADAM12O43184 909 aa21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 HIP1RO75146 1068 aa21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 FGFR3P22607 806 aa21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 GRM5P41594 1212 aa21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 OSTNP61366 133 aa21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 RAB33AQ14088 237 aa21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 ANGPT1Q15389 498 aa21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 ANKS3Q6ZW76 656 aa21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 ASCL5Q7RTU5 278 aa21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 TMEM134Q9H6X4 195 aa21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 TBC1D17Q9HA65 648 aa21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 ARHGEF3Q9NR81 526 aa21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 MTRRQ9UBK8 725 aa21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 PRR23AA6NEV1 266 aa21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
RPS6KB1-208ENST00000489824 NTHL1P78549 312 aa21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms