RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 STK17AQ9UEE5 414 aa25.68■■□□□ 1.7
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C9orf3-215ENST00000478473 TADA2AO75478 443 aa25.67■■□□□ 1.7
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C9orf3-215ENST00000478473 CD300LGQ6UXG3 332 aa25.65■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
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C9orf3-215ENST00000478473 B3GALT6Q96L58 329 aa25.63■■□□□ 1.69
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C9orf3-215ENST00000478473 CLCNKBP51801 687 aa25.61■■□□□ 1.69
C9orf3-215ENST00000478473 FAM171A1Q5VUB5 890 aa25.61■■□□□ 1.69
C9orf3-215ENST00000478473 KANK3Q6NY19 840 aa25.61■■□□□ 1.69
C9orf3-215ENST00000478473 TMC5Q6UXY8 1006 aa25.61■■□□□ 1.69
C9orf3-215ENST00000478473 MAN1C1Q9NR34 630 aa25.61■■□□□ 1.69
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