RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466795.5

RNF13-206, Transcript of ring finger protein 13, human

TSL 4

Gene RNF13, Length 586 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF13-206	ENST00000466795	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	CYP27B1	O15528	508 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	SGTA	O43765	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	RAP2B	P61225	183 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	CRHR2	Q13324	411 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	PPP2R5A	Q15172	486 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	VPS72	Q15906	364 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	USP45	Q70EL2	814 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	RSPH3	Q86UC2	560 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	SYT12	Q8IV01	421 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	TFAP2C	Q92754	450 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	LRGUK	Q96M69	825 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	SPON1	Q9HCB6	807 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNF13-206	ENST00000466795	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	PLSCR1	O15162	318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	PJA2	O43164	708 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	TSPAN6	O43657	245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	RFPL1	O75677	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	ATP5J	P18859	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	AKAP5	P24588	427 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	CLRN1	P58418	232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	PTH1R	Q03431	593 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	TLE1	Q04724	770 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	METTL24	Q5JXM2	366 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	DRC7	Q8IY82	874 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	EXTL1	Q92935	676 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	LEFTY2	O00292	366 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	DTNB	O60941	627 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	ADRB1	P08588	477 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	VCAM1	P19320	739 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	CYP2C19	P33261	490 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	CTXN1	P60606	82 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	SPRED1	Q7Z699	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	MVB12A	Q96EY5	273 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	NEU1	Q99519	415 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	TEX33	O43247	280 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	AP1G1	O43747	822 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	OFD1	O75665	1012 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	SBK3	P0C264	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	SLC6A2	P23975	617 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	SLC6A4	P31645	630 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	RAB39A	Q14964	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	PGS1	Q32NB8	556 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	NRN1L	Q496H8	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF13-206	ENST00000466795	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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