RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460289.5

PTPN4-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-208ENST00000460289 DSG1Q02413 1049 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 ITIH3Q06033 890 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 CEP120Q8N960 986 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 SLC22A17Q8WUG5 538 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 SUSD6Q92537 303 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 RABGGTAQ92696 567 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 BICD1Q96G01 975 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 GPR62Q9BZJ7 368 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.629e-6■■■■■ 68.9
PTPN4-208ENST00000460289 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 K7ENM7 598 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 F13A1P00488 732 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 XKR4Q5GH76 650 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 CES5AQ6NT32 575 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 ALKAL1Q6UXT8 129 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 UROC1Q96N76 676 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 PAAF1Q9BRP4 392 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 RXFP1Q9HBX9 757 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 SLC38A7Q9NVC3 462 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 TBX20Q9UMR3 447 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 ADH1AP07327 375 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 HARSP12081 509 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 EPCAMP16422 314 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 STAT6P42226 847 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 MCL1Q07820 350 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 GLRA4Q5JXX5 417 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 ATL3Q6DD88 541 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 APOL5Q9BWW9 433 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 PANK2Q9BZ23 570 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 ADAM7Q9H2U9 754 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 DPP7Q9UHL4 492 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 LIG4P49917 911 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 CLCN4P51793 760 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 GTF2BQ00403 316 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 CREMQ03060 361 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 DYMQ7RTS9 669 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 DDX12PQ92771 950 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 CACNG4Q9UBN1 327 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPN4-208ENST00000460289 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 TEX28O15482 410 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 KIF4AO95239 1232 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 KCNE1P15382 129 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 KYAT1Q16773 422 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 SNX27Q96L92 541 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 FBXL18Q96ME1 805 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 NECTIN4Q96NY8 510 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 FNIP2Q9P278 1114 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 CFAP45Q9UL16 551 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 CUTAO60888 179 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 C1RP00736 705 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 PIGRP01833 764 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 ALADP13716 330 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 NMT1P30419 496 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 HASPINQ8TF76 798 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 B3GALT6Q96L58 329 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 FIZ1Q96SL8 496 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 TTPALQ9BTX7 342 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 CNTN3Q9P232 1028 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 SEL1LQ9UBV2 794 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 MYMKA6NI61 221 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 SPDYE4A6NLX3 237 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 PI4K2BG5E9Z4 385 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 B3GAT3O94766 335 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 CLTAP09496 248 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 GAP43P17677 238 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 MTHFRP42898 656 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 CLCNKBP51801 687 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 UPP1Q16831 310 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 ATAT1Q5SQI0 421 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 FAM171A1Q5VUB5 890 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 PDILTQ8N807 584 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 KCNG4Q8TDN1 519 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 RIPOR3Q96MK2 946 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 LRRC27Q9C0I9 530 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 EPHX3Q9H6B9 360 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 LOC730098B7Z3J9 87 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 TRAPPC3O43617 180 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPN4-208ENST00000460289 PKP1Q13835 747 aa25.1■■□□□ 1.61
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