RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 ADAM7Q9H2U9 754 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 RXFP1Q9HBX9 757 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 STK17AQ9UEE5 414 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC39Q9UFE4 941 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 LOC730098B7Z3J9 87 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 TEX28O15482 410 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 TADA2AO75478 443 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 KRT18P05783 430 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 ITIH3Q06033 890 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 USP41Q3LFD5 358 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 XKR4Q5GH76 650 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 KIAA1841Q6NSI8 718 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 HASPINQ8TF76 798 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.747e-8■■■■■ 58.7
HOXB3-202ENST00000460160 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 HARSP12081 509 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 YARSP54577 528 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 KANK3Q6NY19 840 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 FBXL18Q96ME1 805 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 FIZ1Q96SL8 496 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 C2orf16Q68DN1 1984 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 ADH1AP07327 375 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 TXLNAP40222 546 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 CES5AQ6NT32 575 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 GPR65Q8IYL9 337 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 LINC00301Q8NCQ3 95 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 SNX27Q96L92 541 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 ACAP3Q96P50 834 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 HAPLN2Q9GZV7 340 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 K7ENM7 598 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 TBCAO75347 108 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 MCL1Q07820 350 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 STK38Q15208 465 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 RRAGBQ5VZM2 374 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 RNF135Q8IUD6 432 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 FEZF2Q8TBJ5 459 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 ZHX3Q9H4I2 956 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 C11orf16Q9NQ32 467 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 TBX20Q9UMR3 447 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 DCXO43602 365 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 TRAK2O60296 914 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 WEE2P0C1S8 567 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 SCP2P22307 547 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 RTP2Q5QGT7 225 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 MYO10Q9HD67 2058 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 A0A087X0B3 334 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 CLDN3O15551 220 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 ALADP13716 330 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 CLCNKBP51801 687 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 UPP1Q16831 310 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 SEZ6Q53EL9 994 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 BICD1Q96G01 975 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 POMKQ9H5K3 350 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP25.89■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 CNTN3Q9P232 1028 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 DENND4AQ7Z401 1863 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXB3-202ENST00000460160 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
HOXB3-202ENST00000460160 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
HOXB3-202ENST00000460160 KCNE1P15382 129 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXB3-202ENST00000460160 NMT1P30419 496 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
HOXB3-202ENST00000460160 FAM171A1Q5VUB5 890 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXB3-202ENST00000460160 TMC5Q6UXY8 1006 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXB3-202ENST00000460160 UROC1Q96N76 676 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXB3-202ENST00000460160 NECTIN4Q96NY8 510 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXB3-202ENST00000460160 TTPALQ9BTX7 342 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXB3-202ENST00000460160 SFXN1Q9H9B4 322 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXB3-202ENST00000460160 FNIP2Q9P278 1114 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXB3-202ENST00000460160 MUTYHQ9UIF7 546 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXB3-202ENST00000460160 TECTAO75443 2155 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXB3-202ENST00000460160 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
HOXB3-202ENST00000460160 SPTLC2O15270 562 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXB3-202ENST00000460160 GLUD1P00367 558 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXB3-202ENST00000460160 PIGRP01833 764 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXB3-202ENST00000460160 RPL17P18621 184 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
HOXB3-202ENST00000460160 MTHFRP42898 656 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXB3-202ENST00000460160 PKP1Q13835 747 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXB3-202ENST00000460160 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXB3-202ENST00000460160 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
HOXB3-202ENST00000460160 CD300LGQ6UXG3 332 aa25.88■■□□□ 1.73
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