RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 FNBP1Q96RU3 617 aa22.66■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 CGRRF1Q99675 332 aa22.66■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 CENPFP49454 3210 aa22.66■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 PJA2O43164 708 aa22.66■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 MYL3P08590 195 aa22.66■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 MAGEA1P43355 309 aa22.66■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 CDT1Q9H211 546 aa22.66■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.66■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 MYO1AQ9UBC5 1043 aa22.66■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 VNN1O95497 513 aa22.65■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 ELNP15502 786 aa22.65■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 HSPA6P17066 643 aa22.65■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 TNNI1P19237 187 aa22.65■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 CASQ1P31415 396 aa22.65■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 CHMP4BP1P59074 171 aa22.65■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 SLC35F6Q8N357 371 aa22.65■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 CEP120Q8N960 986 aa22.65■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.65■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.65■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.65■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 EVPLQ92817 2033 aa22.64■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 KRT86O43790 486 aa22.64■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 ANXA13P27216 316 aa22.64■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 HOXC8P31273 242 aa22.64■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 GJA9P57773 515 aa22.64■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 ARHGEF6Q15052 776 aa22.64■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.64■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.64■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 ZNF410Q86VK4 478 aa22.64■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 NLRP7Q8WX94 980 aa22.64■■□□□ 1.22
GPC1-202ENST00000420138 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.64■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 ZEB2O60315 1214 aa22.64■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 GPR32O75388 356 aa22.64■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 KIF5AQ12840 1032 aa22.64■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 SCARA3Q6AZY7 606 aa22.64■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 SLC30A5Q8TAD4 765 aa22.64■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 RAET1EQ8TD07 263 aa22.64■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 TATDN2Q93075 761 aa22.64■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.64■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.64■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.64■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.215e-8■■■□□ 17.3
GPC1-202ENST00000420138 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 NKX3-2P78367 333 aa22.63■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.63■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 SALL4Q9UJQ4 1053 aa22.63■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 TSPAN1O60635 241 aa22.62■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 URI1O94763 535 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 HLA-DRAP01903 254 aa22.62■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 KIZQ2M2Z5 673 aa22.62■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.62■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 TMEM192Q8IY95 271 aa22.62■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.62■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 FAM71AQ8IYT1 594 aa22.62■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 SHC3Q92529 594 aa22.62■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 NT5C1BQ96P26 610 aa22.62■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 TSGA10Q9BZW7 698 aa22.62■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.62■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 TSKSQ9UJT2 592 aa22.62■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 NAGPAQ9UK23 515 aa22.62■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 SEPT4O43236 478 aa22.61■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 TREHO43280 583 aa22.61■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 CYP2C9P11712 490 aa22.61■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 WDR49Q8IV35 697 aa22.61■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 FMNL3Q8IVF7 1028 aa22.61■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 CPB2Q96IY4 423 aa22.61■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.61■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 PACSIN1Q9BY11 444 aa22.61■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 HMGCRP04035 888 aa22.61■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 MFAP3P55082 362 aa22.61■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.61■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.61■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 PGK1P00558 417 aa22.6■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 MCF2P10911 925 aa22.6■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 GCNT1Q02742 428 aa22.6■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 NAB2Q15742 525 aa22.6■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 MACROD2A1Z1Q3 448 aa22.59■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 FGFR4P22455 802 aa22.59■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 OSTNP61366 133 aa22.59■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 BIRC3Q13489 604 aa22.59■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
GPC1-202ENST00000420138 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.59■■□□□ 1.21
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