RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420058.1

NFE4-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NFE4, Length 1,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE4-201ENST00000420058 NR5A1Q13285 461 aa15.78■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 SLFN12Q8IYM2 578 aa15.78■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 PIGOQ8TEQ8 1089 aa15.78■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 OSBPL6Q9BZF3 934 aa15.78■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa15.78■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 USP20Q9Y2K6 914 aa15.78■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 MYH15Q9Y2K3 1946 aa15.78■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 CHD6Q8TD26 2715 aa15.77■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 ZFHX4Q86UP3 3567 aa15.77■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 EDN1P05305 212 aa15.77■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 POU2F2P09086 479 aa15.77■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 FDPSP14324 419 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 TGM1P22735 817 aa15.77■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 PRKCQQ04759 706 aa15.77■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 RAB33AQ14088 237 aa15.77■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 PSMD5Q16401 504 aa15.77■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 FAM187BQ17R55 369 aa15.77■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 CEP57Q86XR8 500 aa15.77■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 NPAS3Q8IXF0 933 aa15.77■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 HACE1Q8IYU2 909 aa15.77■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 ZBTB44Q8NCP5 570 aa15.77■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 CLDN23Q96B33 292 aa15.77■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa15.77■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 PDZD7Q9H5P4 517 aa15.77■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 LTB4R2Q9NPC1 389 aa15.77■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 SNTG2Q9NY99 539 aa15.77■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 FBXO4Q9UKT5 387 aa15.77■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 PCDHA12Q9UN75 941 aa15.77■□□□□ 0.12
NFE4-201ENST00000420058 VWA8A3KMH1 1905 aa15.76■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 STK36Q9NRP7 1315 aa15.76■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa15.76■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 MARCH6O60337 910 aa15.76■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 REC8O95072 547 aa15.76■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 BAG4O95429 457 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa15.76■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP15.76■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 FGFR3P22607 806 aa15.76■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 PPM1LQ5SGD2 360 aa15.76■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 ZNF687Q8N1G0 1237 aa15.76■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 BSNDQ8WZ55 320 aa15.76■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 MTMR9Q96QG7 549 aa15.76■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 KXD1Q9BQD3 176 aa15.76■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 BCO2Q9BYV7 579 aa15.76■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 TPCN1Q9ULQ1 816 aa15.76■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 LAMTOR5O43504 91 aa15.75■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 PFKFB2O60825 505 aa15.75■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 KINO60870 393 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 LILRB5O75023 590 aa15.75■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 TARSP26639 723 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 OR1D2P34982 312 aa15.75■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 UBXN2BQ14CS0 331 aa15.75■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 UVSSAQ2YD98 709 aa15.75■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 LIN9Q5TKA1 542 aa15.75■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 MTSS1LQ765P7 747 aa15.75■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 MAEAQ7L5Y9 396 aa15.75■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 SLC7A14Q8TBB6 771 aa15.75■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 PRIMPOLQ96LW4 560 aa15.75■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 HINFPQ9BQA5 517 aa15.75■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 PDRG1Q9NUG6 133 aa15.75■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 KCNH3Q9ULD8 1083 aa15.75■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 USO1O60763 962 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 RECQL4O94761 1208 aa15.74■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 THP07101 528 aa15.74■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 SLC5A9Q2M3M2 681 aa15.74■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 EEF1DP3Q658K8 133 aa15.74■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 NOSTRINQ8IVI9 506 aa15.74■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 BORCS6Q96GS4 357 aa15.74■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 CCDC113Q9H0I3 377 aa15.74■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 MTRRQ9UBK8 725 aa15.74■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 POLIQ9UNA4 740 aa15.74■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa15.74■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 MIA3Q5JRA6 1907 aa15.74■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 LRRIQ4A6NIV6 560 aa15.73■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 SPTLC1O15269 473 aa15.73■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 XYLBO75191 536 aa15.73■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 TDGF1P13385 188 aa15.73■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 TXKP42681 527 aa15.73■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 CALCRLQ16602 461 aa15.73■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa15.73■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 TANGO2Q6ICL3 276 aa15.73■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 TSSK4Q6SA08 328 aa15.73■□□□□ 0.11
NFE4-201ENST00000420058 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms