RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.56■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 DZANK1Q9NVP4 752 aa22.56■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.55■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 TRAK2O60296 914 aa22.55■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 KLRC2P26717 231 aa22.55■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 CLCN4P51793 760 aa22.55■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 OSTNP61366 133 aa22.55■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 ITIH3Q06033 890 aa22.55■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 STK38Q15208 465 aa22.55■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 GLRA4Q5JXX5 417 aa22.55■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.55■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 ACAP3Q96P50 834 aa22.55■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 FIZ1Q96SL8 496 aa22.55■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 APOL5Q9BWW9 433 aa22.55■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.55■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa22.54■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP6R2O75170 966 aa22.54■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 KIF4AO95239 1232 aa22.54■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.54■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.23e-6■■■■■ 36
UBE2E3-201ENST00000392415 SPTLC2O15270 562 aa22.53■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 TEX28O15482 410 aa22.53■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 CLDN3O15551 220 aa22.53■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 ADH1AP07327 375 aa22.53■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 MCL1Q07820 350 aa22.53■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 CES5AQ6NT32 575 aa22.53■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.53■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 B3GALT6Q96L58 329 aa22.53■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 SNX27Q96L92 541 aa22.53■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.53■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.53■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.53■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 TBX20Q9UMR3 447 aa22.53■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 LOC730098B7Z3J9 87 aa22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 K7ENM7 598 aa22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 F13A1P00488 732 aa22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 PIGRP01833 764 aa22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 HARSP12081 509 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 ABCD1P33897 745 aa22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 SV2BQ7L1I2 683 aa22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 HASPINQ8TF76 798 aa22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 FBXL18Q96ME1 805 aa22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 UROC1Q96N76 676 aa22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 PLXNA3P51805 1871 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 YEATS4O95619 227 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNE1P15382 129 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 GTF2BQ00403 316 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 UPP1Q16831 310 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 DYMQ7RTS9 669 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 DDX12PQ92771 950 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 BICD1Q96G01 975 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 NECTIN4Q96NY8 510 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 CNTN3Q9P232 1028 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 FNIP2Q9P278 1114 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 CDH22Q9UJ99 828 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 VWA8A3KMH1 1905 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 A0A087X0B3 334 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 MYMKA6NI61 221 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 C1RP00736 705 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 ALADP13716 330 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 LIG4P49917 911 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 CLCNKBP51801 687 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 RTP2Q5QGT7 225 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 PANK2Q9BZ23 570 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 B3GAT3O94766 335 aa22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 STAT6P42226 847 aa22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 MTHFRP42898 656 aa22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 PKP1Q13835 747 aa22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3-201ENST00000392415 SEZ6Q53EL9 994 aa22.49■■□□□ 1.19
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