RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa23.87■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 ADAM28Q9UKQ2 775 aa23.87■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 C2orf16Q68DN1 1984 aa23.86■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa23.86■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 CASTOR2A6NHX0 329 aa23.86■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 F8W810 466 aa23.86■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 H0Y858 1186 aa23.86■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 H0YCG3 227 aa23.86■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 STX6O43752 255 aa23.86■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 EPCAMP16422 314 aa23.86■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 PLCG1P19174 1290 aa23.86■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 GRIN1Q05586 938 aa23.86■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 RABGGTAQ92696 567 aa23.86■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 KLHL5Q96PQ7 755 aa23.86■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 PTGESO14684 152 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 ASGR2P07307 311 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 ADH1AP07327 375 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 CNPP09543 421 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 TXLNAP40222 546 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 NUBP1P53384 320 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 USP41Q3LFD5 358 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 FUT10Q6P4F1 479 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 FAM173BQ6P4H8 233 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 TAS1R1Q7RTX1 841 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 FEZF2Q8TBJ5 459 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 CDT1Q9H211 546 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 ODF2LQ9ULJ1 636 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 MTMR6Q9Y217 621 aa23.85■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP23.84■■□□□ 1.415e-9■■■■■ 129.7
NME4-201ENST00000219479 FAM13AO94988 1023 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 HARSP12081 509 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 OSTNP61366 133 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 MPZL3Q6UWV2 235 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 TAS1R3Q7RTX0 852 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 TMEM105Q8N8V8 129 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 SLC22A17Q8WUG5 538 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 RAD54LQ92698 747 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 SNX21Q969T3 373 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 BICD1Q96G01 975 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 REEP2Q9BRK0 252 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 ZHX3Q9H4I2 956 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 CACNG4Q9UBN1 327 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 CCDC39Q9UFE4 941 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 SPTBN4Q9H254 2564 aa23.84■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 TBCAO75347 108 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 MCF2P10911 925 aa23.83■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 GRM5P41594 1212 aa23.83■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP23.83■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 DSG1Q02413 1049 aa23.83■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 MCM6Q14566 821 aa23.83■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 PTPAQ15257 358 aa23.83■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 ARSHQ5FYA8 562 aa23.83■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 GLRA4Q5JXX5 417 aa23.83■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa23.83■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 MYCT1Q8N699 235 aa23.83■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 HASPINQ8TF76 798 aa23.83■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 GPR62Q9BZJ7 368 aa23.83■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 DPP7Q9UHL4 492 aa23.83■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
NME4-201ENST00000219479 LILRB3O75022 631 aa23.82■■□□□ 1.4
NME4-201ENST00000219479 MAPTP10636 758 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
NME4-201ENST00000219479 CLCN4P51793 760 aa23.82■■□□□ 1.4
NME4-201ENST00000219479 CREMQ03060 361 aa23.82■■□□□ 1.4
NME4-201ENST00000219479 SPECC1Q5M775 1068 aa23.82■■□□□ 1.4
NME4-201ENST00000219479 ATAT1Q5SQI0 421 aa23.82■■□□□ 1.4
NME4-201ENST00000219479 KIAA0319Q5VV43 1072 aa23.82■■□□□ 1.4
NME4-201ENST00000219479 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
NME4-201ENST00000219479 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
NME4-201ENST00000219479 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
NME4-201ENST00000219479 B3GALT6Q96L58 329 aa23.82■■□□□ 1.4
NME4-201ENST00000219479 PAAF1Q9BRP4 392 aa23.82■■□□□ 1.4
NME4-201ENST00000219479 CCSER1Q9C0I3 900 aa23.82■■□□□ 1.4
NME4-201ENST00000219479 SFXN1Q9H9B4 322 aa23.82■■□□□ 1.4
NME4-201ENST00000219479 PARVGQ9HBI0 331 aa23.82■■□□□ 1.4
NME4-201ENST00000219479 PTPRHQ9HD43 1115 aa23.82■■□□□ 1.4
NME4-201ENST00000219479 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP23.82■■□□□ 1.44e-9■■■■■ 61.2
NME4-201ENST00000219479 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa23.82■■□□□ 1.4
NME4-201ENST00000219479 LIMD1Q9UGP4 676 aa23.82■■□□□ 1.4
NME4-201ENST00000219479 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
NME4-201ENST00000219479 DMDP11532 3685 aa23.81■■□□□ 1.4
NME4-201ENST00000219479 TEX28O15482 410 aa23.81■■□□□ 1.4
NME4-201ENST00000219479 TOM1L1O75674 476 aa23.81■■□□□ 1.4
NME4-201ENST00000219479 KIF4AO95239 1232 aa23.81■■□□□ 1.4
NME4-201ENST00000219479 GLUD1P00367 558 aa23.81■■□□□ 1.4
NME4-201ENST00000219479 TMC5Q6UXY8 1006 aa23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms