RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W HXT14P42833 540 aa9.3□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W DAN1P47178 298 aa9.3□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W YGR012WP53206 393 aa9.3□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data9.3□□□□□ -0.92not detected
PRP4YPR178W INP1Q03694 420 aa9.3□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W YDL086WQ07505 273 aa9.3□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W RRT7Q07829 113 aa9.3□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W MMP1Q12372 583 aa9.3□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W Q0182Q9ZZW1 134 aa9.3□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W RPB3P16370 318 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W ADH7P25377 361 aa9.29□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W CLB6P32943 380 aa9.29□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W SDH4P37298 181 aa9.29□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W AVT5P38176 459 aa9.29□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W OSW5P40219 148 aa9.29□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W YIL077CP40508 320 aa9.29□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W ADO1P47143 340 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W BXI1P48558 297 aa9.29□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W PUS4P48567 403 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W UBP8P50102 471 aa9.29□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W YML096WQ04489 525 aa9.29□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W SMA2Q04658 369 aa9.29□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W GLO4Q12320 285 aa9.29□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W AI1P03875 834 aa9.28□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W ADH3P07246 375 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W SAC7P17121 654 aa9.28□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W SCL1P21243 252 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W GPX1P36014 167 aa9.28□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W POP8P38208 133 aa9.28□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W SPC25P40014 221 aa9.28□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W YJR056CP47115 236 aa9.28□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W OCA1P50946 238 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W YLR152CP54072 576 aa9.28□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W ACS1Q01574 713 aa9.28□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W YPL108WQ02872 168 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W HNT1Q04344 158 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W YMR253CQ04835 414 aa9.28□□□□□ -0.92
PRP4YPR178W FPR1P20081 114 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W SNC2P33328 115 aa9.27□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W MSN4P33749 630 aa9.27□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W MRPL4P36517 319 aa9.27□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W PRS2P38620 318 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W CHS7P38843 316 aa9.27□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W RPL13BP40212 199 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W SLM1P40485 686 aa9.27□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W NIT3P49954 291 aa9.27□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W ACS2P52910 683 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W YIP4P53093 235 aa9.27□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W AQR1P53943 586 aa9.27□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W YML018CQ03730 393 aa9.27□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W MRX8Q05473 314 aa9.27□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W HEM25Q07534 307 aa9.27□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W RDR1Q08904 546 aa9.27□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W RAD28Q12021 506 aa9.27□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W DCN1Q12395 269 aa9.27□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W SPT15P13393 240 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W SEC59P20048 519 aa9.26□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W NUP1P20676 1076 aa9.26□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W GAS1P22146 559 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W TRS65P32893 560 aa9.26□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W SSS1P35179 80 aa9.26□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W PEX28P38848 579 aa9.26□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W LSM4P40070 187 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W FMP10P40098 244 aa9.26□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W MNN10P50108 393 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W UFD1P53044 361 aa9.26□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W NPY1P53164 384 aa9.26□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W PKP2P53170 491 aa9.26□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W CAB5Q03941 241 aa9.26□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W SET6Q12529 373 aa9.26□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W COX19Q3E731 98 aa9.26□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W MEX67Q99257 599 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W YLR358CO13565 187 aa9.25□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W PTR2P32901 601 aa9.25□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W SLC1P33333 303 aa9.25□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data9.25□□□□□ -0.93not detected
PRP4YPR178W RRP3P38712 501 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W DLS1P40366 167 aa9.25□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W ERV14P53173 138 aa9.25□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W TPC1P53257 314 aa9.25□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W YDR248CQ03786 193 aa9.25□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W PML1Q07930 204 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W HRT1Q08273 121 aa9.25□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W LEU9Q12166 604 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W GAL7P08431 366 aa9.24□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W POF1P25576 258 aa9.24□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W YNK1P36010 153 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W RIB5P38145 238 aa9.24□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W EHT1P38295 451 aa9.24□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W YPT31P38555 223 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W TOK1P40310 691 aa9.24□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W MEH1Q02205 184 aa9.24□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W TMA23Q03525 211 aa9.24□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W ERP1Q05359 219 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W VAM3Q12241 283 aa9.24□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W RPS13P05756 151 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W SSH1P38353 490 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W YIL067CP40514 678 aa9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.5 ms