RNA–Protein interactions for RNA: YPL253C

VIK1, Transcript of Protein that forms a kinesin-14 heterodimeric motor with Kar3p, yeast

Gene VIK1, Length 1,944 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	YPL253C	SDC1	Q03323	175 aa		0.34	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	PEX12	Q04370	399 aa		0.34	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	ERV41	Q04651	352 aa		0.34	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	YLR413W	Q06689	675 aa		0.34	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YSR3	P23501	404 aa		0.34	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	SUA5	P32579	426 aa		0.34	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	CSG2	P35206	410 aa		0.34	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YHL049C	P38722	271 aa		0.34	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	LOH1	P47055	219 aa		0.34	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	MDM34	P53083	459 aa		0.34	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	SWS2	P53937	143 aa		0.34	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YNL050C	P53952	270 aa		0.34	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	VPS60	Q03390	229 aa		0.34	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YMR209C	Q03648	457 aa		0.34	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YML018C	Q03730	393 aa		0.34	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	SFH1	Q06168	426 aa		0.34	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	FMP16	Q12497	93 aa		0.34	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	POX1	P13711	748 aa		0.33	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	EHD3	P28817	500 aa		0.33	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.33	□□□□□ -2.36	RIP-Chip
VIK1	YPL253C	HSM3	P38348	480 aa		0.33	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YHI9	P38765	294 aa		0.33	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	SNX4	P47057	423 aa		0.33	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YGL034C	P53186	121 aa		0.33	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YNL260C	P53846	198 aa		0.33	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	SPP2	Q02521	185 aa		0.33	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	TAF9	Q05027	157 aa		0.33	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	BCP1	Q06338	283 aa		0.33	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	GPN3	Q06543	272 aa		0.33	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YPR011C	Q12251	326 aa		0.33	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YAL064W-B	O13512	126 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	OM45	P16547	393 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	PPH21	P23594	369 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	DRE2	P36152	348 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	MRPL37	P36532	105 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	TDA11	P38854	504 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	COA1	P40452	197 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YIA6	P40556	373 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	TAD2	P47058	250 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YJL028W	P47062	111 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	MNT4	P53745	580 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	AAH1	P53909	347 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	CTF19	Q02732	369 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	OST6	Q03723	332 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	ATC1	Q04005	294 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	EMI1	Q04406	187 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	SEC10	Q06245	871 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	GEP5	Q12393	293 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	COX2	P00410	251 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YGL010W	P25338	174 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	DAL80	P26343	269 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	QRI5	P32344	111 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YBR096W	P38256	230 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	PRM9	P39551	298 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	MEP1	P40260	492 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	GLG2	P47011	380 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	GPI8	P49018	411 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	KEL2	P50090	882 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	NIF3	P53081	288 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	MAL13	P53338	473 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	ARP5	P53946	755 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	RSM10	Q03201	203 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	PER33	Q12144	273 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	DCN1	Q12395	269 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YOS9	Q99220	542 aa		0.32	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	TOM1	Q03280	3268 aa		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	CCA1	P21269	546 aa		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	RIB7	P33312	244 aa		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	JEN1	P36035	616 aa		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	ECM13	P38195	257 aa		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	BIG1	P38813	335 aa		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	SNZ3	P43545	298 aa		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	AGX1	P43567	385 aa		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	MRX5	P47007	382 aa		0.31	□□□□□ -2.36

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