RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	FMT1	P32785	401 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YAL037W	P39728	267 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	ERG28	P40030	148 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YER158C	P40095	573 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	STE24	P47154	453 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	MTO1	P53070	669 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	GPG1	P53130	126 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	AAH1	P53909	347 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YNL092W	P53934	400 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	COQ10	Q08058	207 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	GPM2	Q12008	311 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	FCY22	Q12119	530 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	UBX3	Q12229	455 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	CTF3	Q12748	733 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	TIR1	P10863	254 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.72	□□□□□ -1.65	not detected
EXO1	YOR033C	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	DOG2	P38773	246 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	OXA1	P39952	402 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YEA6	P39953	335 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YIL060W	P40519	144 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	MOB2	P43563	287 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	EXG2	P52911	562 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YGL235W	P53071	178 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	TIM8	P57744	87 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	APS2	Q00381	147 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	RSM23	Q01163	450 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YLR446W	Q06204	433 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YLR030W	Q07967	263 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	IRC10	Q08118	586 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	FRE8	Q12209	686 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	ANB1	P19211	157 aa		4.71	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	RPB5	P20434	215 aa		4.71	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YKL070W	P36087	169 aa		4.71	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	LDB7	P38210	180 aa		4.71	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	REG2	P38232	338 aa		4.71	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	TAH11	P47112	604 aa		4.71	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YLR460C	P54007	376 aa		4.71	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	TMA23	Q03525	211 aa		4.71	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YMR210W	Q03649	449 aa		4.71	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	GPI11	Q06636	219 aa		4.71	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	GUD1	Q07729	489 aa		4.71	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	IRC13	Q08630	104 aa		4.71	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.7	□□□□□ -1.66	not detected
EXO1	YOR033C	VAR1	P02381	398 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	ERS1	P17261	260 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	PCL1	P24867	279 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	SGF29	P25554	259 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	ADK2	P26364	225 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	CLB6	P32943	380 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	SPC29	P33419	253 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	MSN2	P33748	704 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	TIR2	P33890	251 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	ASH1	P34233	588 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	SCD5	P34758	872 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	PET10	P36139	283 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	POP8	P38208	133 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	BMT5	P40493	336 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	GTS1	P40956	396 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YIP4	P53093	235 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	GIP3	Q03016	1276 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	RCE1	Q03530	315 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	GEP5	Q12393	293 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	RAS1	P01119	309 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	MSW1	P04803	379 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	RIP1	P08067	215 aa		4.7	□□□□□ -1.66

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