RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W RNA15P25299 296 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W IDH2P28241 369 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W EMP24P32803 203 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W FRE2P36033 711 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W AIM29P36154 155 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W RIB1P38066 345 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W MET30P39014 640 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W PRM9P39551 298 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W SWM2P40342 146 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YIL169CP40442 995 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W GDS1P41913 522 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YAE1P47118 141 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W UFD1P53044 361 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W PRM1P53835 661 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W GIP3Q03016 1276 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YMR130WQ04223 302 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W VBA1Q04301 562 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YMR254CQ04838 102 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YLR413WQ06689 675 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YOR365CQ08844 703 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W SIA1Q12212 622 aa3.49□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YEL009C-AA0A023PZF2 135 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W HOM3P10869 527 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W POF1P25576 258 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W ADK2P26364 225 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W DEG1P31115 442 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data3.48□□□□□ -1.85not detected
HCA4YJL033W SFC1P33303 322 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W SKT5P34226 696 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W UBA4P38820 440 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W SPO73P40031 143 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W LSM5P40089 93 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W BUR6P40096 142 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W RFC4P40339 323 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W ADO1P47143 340 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W EMC4P53073 190 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W BOL2P53082 120 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YGL185CP53100 379 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W THP1Q08231 455 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W MHT1Q12525 324 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W HTB1P02293 131 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W HTB2P02294 131 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W CDC21P06785 304 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W NHP6BP11633 99 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W ARF2P19146 181 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W RRP7P25368 297 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W SHE3P38272 425 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W SHG1P38337 142 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W ISC1P40015 477 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W MPM1P40364 252 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W AZF1P41696 914 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W PRM10P42946 383 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W RPA34P47006 233 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W DAN1P47178 298 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W PEX31P53203 462 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W GTR2P53290 341 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W MTQ1P53944 314 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W CDC14Q00684 551 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data3.48□□□□□ -1.85not detected
HCA4YJL033W PIR3Q03180 325 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W MSS11Q03825 758 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W RTT103Q05543 409 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W ANT1Q06497 328 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W SLH1P53327 1967 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YLR422WQ06409 1932 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W UBR2Q07963 1872 aa3.48□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W ERD1P16151 362 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W MSN4P33749 630 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W SSH1P38353 490 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W RRP3P38712 501 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YHR122WP38829 231 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W MDM31P38880 579 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W ALP1P38971 573 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W RRG9P40156 214 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W PRE6P40303 254 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W VMA21P41806 77 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W AGX1P43567 385 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W IBD2P53892 351 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YOL019WQ08157 551 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W FYV7Q12247 151 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W RDI1Q12434 202 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W RAS2P01120 322 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W RPL9AP05738 191 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W CDC7P06243 507 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W SUA5P32579 426 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W COX13P32799 129 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W MRPL28P36527 147 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W SDH4P37298 181 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W DTR1P38125 572 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W MTC4P38335 694 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W GCV3P39726 170 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W POG1P40473 351 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YJL132WP47014 750 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W AIM25P47140 327 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W RPL9BP51401 191 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W SDT1P53078 280 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W EMI1Q04406 187 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W MRPL35Q06678 367 aa3.47□□□□□ -1.85
HCA4YJL033W YDL218WQ07629 317 aa3.47□□□□□ -1.85
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