RNA–Protein interactions for RNA: YHR195W

NVJ1, Transcript of Nuclear envelope protein, yeast

Gene NVJ1, Length 966 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NVJ1	YHR195W	DSF1	P0CX08	502 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	EHD3	P28817	500 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	MKK1	P32490	508 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	CLG1	P35190	452 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	AVT5	P38176	459 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YJR079W	P47126	109 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	BIR1	P47134	954 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	NUP57	P48837	541 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	COG7	P53195	279 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	SHY1	P53266	389 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	ASI3	P53983	676 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	VBA1	Q04301	562 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	INM2	Q05533	292 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	IRC25	Q07951	179 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	FDH1	Q08911	376 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YCT1	Q12235	531 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	SEC22	P22214	214 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	HSP30	P25619	332 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
NVJ1	YHR195W	JEN1	P36035	616 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	BDH1	P39714	382 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YGR201C	P42936	225 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YCH1	P42937	148 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	SWC4	P53201	476 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	NRK1	P53915	240 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YNL095C	P53932	642 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	RFU1	Q08003	200 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	JID1	Q12350	301 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	SPT3	P06844	337 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YCR102C	P25608	368 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	RMD6	P39975	231 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YFL040W	P43562	540 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YPI1	P43587	155 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	AIM23	P47015	356 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	BNS1	P50084	137 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	CRH1	P53301	507 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	HCH1	P53834	153 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	DYN2	Q02647	92 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	KIN28	P06242	306 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	COS2	P0CX12	379 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	COS3	P0CX13	379 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	RPB5	P20434	215 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
NVJ1	YHR195W	HEM14	P40012	539 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	ATG18	P43601	500 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	CLD1	P53264	445 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YNR066C	P53752	436 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	COG5	P53951	403 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	AIM34	Q03673	198 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	YMD8	Q03697	442 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	PLP1	Q04004	230 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	RPN6	Q12377	434 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NVJ1	YHR195W	HEM4	P06174	275 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	ERD1	P16151	362 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	CPT1	P17898	393 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	SWD3	P38123	315 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	ECM13	P38195	257 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	COG3	P40094	801 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	DFG10	P40526	253 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	TIS11	P47977	285 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	JAC1	P53193	184 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	DYN3	Q04949	312 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	AKR2	Q12013	749 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	SLM3	Q12093	417 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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