RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	YAL064W-B	O13512	126 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	STF2	P16965	84 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	EHD3	P28817	500 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	KRE6	P32486	720 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	MTC7	P32633	139 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	YER184C	P39961	794 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	TIR3	P40552	269 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	PGU1	P47180	361 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	MTL1	P53214	551 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	PEX25	Q02969	394 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	RSM28	Q03430	361 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	YDR249C	Q03787	373 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	GAS2	Q06135	555 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	CTS2	Q06350	511 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	MIM1	Q08176	113 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	ORT1	Q12375	292 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	PCL1	P24867	279 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	THI4	P32318	326 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	MCM10	P32354	571 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	LST4	P34239	828 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	APD1	P38281	316 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	UME6	P39001	836 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	SHO1	P40073	367 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	AIM25	P47140	327 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	AIM36	Q03798	255 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	PLP1	Q04004	230 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	MIX14	Q04341	121 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	MDM30	Q05930	598 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	DBF20	P32328	564 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	PPG1	P32838	368 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	MRPL3	P36516	390 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	YIL060W	P40519	144 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	REE1	P40893	198 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	UBX6	P47049	396 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	BSC5	P53755	489 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	YLR152C	P54072	576 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	YMR130W	Q04223	302 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	YLR352W	Q06479	807 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	TMS1	Q12116	473 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	PET122	P10355	254 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	OTU1	P43558	301 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	CIN2	P46670	268 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	MRPL50	P53724	139 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	YPL039W	Q03080	316 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	NUP53	Q03790	475 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	NNT1	Q05874	261 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	RDI1	Q12434	202 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	IRA1	P18963	3092 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	STE4	P18851	423 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	MDH2	P22133	377 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	NAM9	P27929	486 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	SYG1	P40528	902 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	SAM50	P53969	484 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	CTF19	Q02732	369 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	SDC1	Q03323	175 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	VBA1	Q04301	562 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	YLR031W	Q07978	186 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	HNT3	Q08702	217 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	ODC2	Q99297	307 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	FLO9	P39712	1322 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YCK1	YHR135C	MSW1	P04803	379 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YCK1	YHR135C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YCK1	YHR135C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YCK1	YHR135C	CDC23	P16522	626 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YCK1	YHR135C	DLS1	P40366	167 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YCK1	YHR135C	YIL169C	P40442	995 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YCK1	YHR135C	BUD8	P41698	603 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YCK1	YHR135C	ECO1	P43605	281 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YCK1	YHR135C	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
YCK1	YHR135C	MSY1	P48527	492 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YCK1	YHR135C	NIT3	P49954	291 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YCK1	YHR135C	MTM1	P53320	366 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YCK1	YHR135C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
YCK1	YHR135C	MCH4	Q08268	501 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YCK1	YHR135C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.4	□□□□□ -1.55	not detected
YCK1	YHR135C	PET18	P25362	215 aa		5.39	□□□□□ -1.55

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