RNA–Protein interactions for RNA: YGR089W

NNF2, Transcript of Protein that exhibits physical and genetic interactions with Rpb8p, yeast

Gene NNF2, Length 2,811 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NNF2	YGR089W	AIM20	P40451	204 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	AYR1	P40471	297 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YJL118W	P47022	219 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YPR1	Q12458	312 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	TY2B-B	Q12491	1770 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	COS2	P0CX12	379 aa		0.24	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	COS3	P0CX13	379 aa		0.24	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	CSG2	P35206	410 aa		0.24	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	RPC37	P36121	282 aa		0.24	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	HMT1	P38074	348 aa		0.24	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	CAB5	Q03941	241 aa		0.24	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	PPH21	P23594	369 aa		0.24	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	SMI1	P32566	505 aa		0.24	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	UIP5	P36137	443 aa		0.24	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	MDM34	P53083	459 aa		0.24	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	SDC1	Q03323	175 aa		0.24	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	VPS60	Q03390	229 aa		0.24	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YMR209C	Q03648	457 aa		0.24	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	PEX12	Q04370	399 aa		0.24	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	GEP5	Q12393	293 aa		0.24	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	BOL1	Q3E793	110 aa		0.24	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	MYO4	P32492	1471 aa		0.24	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	NUP159	P40477	1460 aa		0.24	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	SCC2	Q04002	1493 aa		0.24	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	ATP6	P00854	259 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	SCM4	P32564	187 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	SFC1	P33303	322 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YKL063C	P35725	167 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YHI9	P38765	294 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YJL028W	P47062	111 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	COX16	P47081	118 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YPL077C	Q02831	240 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	TAF9	Q05027	157 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YPK9	Q12697	1472 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	FIG2	P25653	1609 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	CDC7	P06243	507 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	PUT1	P09368	476 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	APE4	P38821	490 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	SPT8	P38915	602 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	END3	P39013	349 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YER135C	P40082	130 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	SNX4	P47057	423 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	TAD2	P47058	250 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	IBA57	P47158	497 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	GTO1	P48239	356 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	NIF3	P53081	288 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	RSM10	Q03201	203 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	VPS20	Q04272	221 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	ASR1	Q06834	288 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	SIA1	Q12212	622 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	FMP27	Q06179	2628 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	SER33	P40510	469 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YIA6	P40556	373 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	AGX1	P43567	385 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	DAD3	P69850	94 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	EMI1	Q04406	187 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	INM2	Q05533	292 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YLR297W	Q05899	129 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	POM33	Q12164	279 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	SAS5	Q99314	248 aa		0.23	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	SGA1	P08019	549 aa		0.22	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	PET18	P25362	215 aa		0.22	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	RNP1	P32385	249 aa		0.22	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	TEM1	P38987	245 aa		0.22	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	SSO2	P39926	295 aa		0.22	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	GLE2	P40066	365 aa		0.22	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	PEP8	P40335	379 aa		0.22	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	ABZ2	Q03266	374 aa		0.22	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YBT1	P32386	1661 aa		0.22	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	PDR11	P40550	1411 aa		0.22	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	UBR2	Q07963	1872 aa		0.22	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YAL064W-B	O13512	126 aa		0.22	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	RAD3	P06839	778 aa		0.22	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YOL162W	P0CF19	215 aa		0.22	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	CCA1	P21269	546 aa		0.22	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	GPI12	P23797	304 aa		0.22	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	MAL32	P38158	584 aa		0.22	□□□□□ -2.37

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