RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRIQ4A6NIV6 560 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 BTBD18B2RXH4 712 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 LARGE1O95461 756 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 LAMP2P13473 410 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR152Q8TDT2 470 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 HASPINQ8TF76 798 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 NXPE3Q969Y0 559 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D17Q9HA65 648 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 TADA2AO75478 443 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS13AQ96RL7 3174 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP28.41■■■□□ 2.149e-10■■■■□ 24.3
CAPNS1-211ENST00000590874 TTLL13PA6NNM8 815 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 ANHXE9PGG2 379 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 ZMYND10O75800 440 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 FOSBP53539 338 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 CREMQ03060 361 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 HTR4Q13639 388 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 ME3Q16798 604 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 CASTOR2A6NHX0 329 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF4AO95239 1232 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 RFX1P22670 979 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 TUSC3Q13454 348 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD1Q15327 319 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 GTF3C6Q969F1 213 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 PRIMPOLQ96LW4 560 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 CXCL16Q9H2A7 254 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM60Q9H2L4 133 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXW11Q9UKB1 542 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 NUMBLQ9Y6R0 609 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 PTGESO14684 152 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 FZD8Q9H461 694 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 PDZD7Q9H5P4 517 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 BSNDQ8WZ55 320 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 CLSTN3Q9BQT9 956 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGEF3Q9NR81 526 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 SNTG2Q9NY99 539 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 DOCK8Q8NF50 2099 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 JAK2O60674 1132 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 MED24O75448 989 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 DCNP07585 359 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 FSHRP23945 695 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 NTHL1P78549 312 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM187BQ17R55 369 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 SPECC1Q5M775 1068 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM171A1Q5VUB5 890 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 CATSPER3Q86XQ3 398 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP57Q86XR8 500 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 MCPH1Q8NEM0 835 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 PIK3R5Q8WYR1 880 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 TTPALQ9BTX7 342 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 USP20Q9Y2K6 914 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 RECQL4O94761 1208 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP2B1P20020 1258 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 ANAPC15P60006 121 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXK2Q01167 660 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 NAB2Q15742 525 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 TUFT1Q9NNX1 390 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 N4BP3O15049 544 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAM12O43184 909 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 EDN1P05305 212 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMD5Q16401 504 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 FGF14Q92915 247 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 R4GN57 208 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 THP07101 528 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 C8AP07357 584 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 MCM7P33993 719 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 LIN9Q5TKA1 542 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 PARM1Q6UWI2 310 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 NOSTRINQ8IVI9 506 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC113Q9H0I3 377 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 CDH7Q9ULB5 785 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 SIT1Q9Y3P8 196 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-211ENST00000590874 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM29Q14134 588 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM132AQ24JP5 1023 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 PPM1LQ5SGD2 360 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 EEF1DP3Q658K8 133 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXQ1Q9C009 403 aa28.32■■■□□ 2.12
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