RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	CLCN4	P51793	760 aa		23.94	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	ITIH3	Q06033	890 aa		23.94	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	REST	Q13127	1097 aa		23.94	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	TUSC3	Q13454	348 aa		23.94	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	PTPA	Q15257	358 aa		23.94	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	ARSH	Q5FYA8	562 aa		23.94	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		23.94	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		23.94	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		23.94	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		23.94	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		23.94	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	23.93	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	ABLIM1	O14639	778 aa		23.93	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	UROD	P06132	367 aa		23.93	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	PLS3	P13797	630 aa		23.93	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	UBA7	P41226	1012 aa		23.93	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	DSG1	Q02413	1049 aa		23.93	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		23.93	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		23.93	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		23.93	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	RABGGTA	Q92696	567 aa		23.93	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		23.93	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		23.93	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC16A4	O15374	487 aa		23.93	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	TH	P07101	528 aa		23.93	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	COL9A1	P20849	921 aa		23.93	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	PROZ	P22891	400 aa		23.93	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	GLUD2	P49448	558 aa		23.93	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	23.93	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	FUT10	Q6P4F1	479 aa		23.93	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		23.93	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	23.93	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	CDT1	Q9H211	546 aa		23.93	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		23.93	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		23.93	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		23.93	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	GDA	Q9Y2T3	454 aa		23.93	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	CLIC4	Q9Y696	253 aa		23.93	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		23.92	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		23.92	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	BRD1	O95696	1058 aa		23.92	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	23.92	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR65	Q8IYL9	337 aa		23.92	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	23.92	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNN1	Q92952	543 aa		23.92	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	CALML4	Q96GE6	196 aa		23.92	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		23.92	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	23.92	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		23.92	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	MTMR6	Q9Y217	621 aa		23.92	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	TECTA	O75443	2155 aa		23.91	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	PLXNA3	P51805	1871 aa		23.91	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	C2CD2L	O14523	706 aa		23.91	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	TEX28	O15482	410 aa		23.91	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	KLRC2	P26717	231 aa		23.91	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	CES5A	Q6NT32	575 aa		23.91	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	KANK3	Q6NY19	840 aa		23.91	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		23.91	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	23.91	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	CEP120	Q8N960	986 aa		23.91	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	B3GALT6	Q96L58	329 aa		23.91	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		23.9	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	23.9	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	GRM5	P41594	1212 aa		23.9	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	23.9	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	23.9	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	USP41	Q3LFD5	358 aa		23.9	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	XKR4	Q5GH76	650 aa		23.9	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	23.9	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		23.9	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		23.9	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	SNX21	Q969T3	373 aa		23.9	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXL18	Q96ME1	805 aa		23.9	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		23.9	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	23.9	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		23.9	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	POMK	Q9H5K3	350 aa		23.9	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	CIT	O14578	2027 aa		23.89	■■□□□ 1.42
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF4A	O95239	1232 aa		23.89	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	PLCG1	P19174	1290 aa		23.89	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	SMTN	P53814	917 aa		23.89	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		23.89	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	RAD54L	Q92698	747 aa		23.89	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	REEP2	Q9BRK0	252 aa		23.89	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	23.89	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		23.89	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	23.88	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	TADA2A	O75478	443 aa		23.88	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	ADH1A	P07327	375 aa		23.88	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	WEE2	P0C1S8	567 aa		23.88	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	MCF2	P10911	925 aa		23.88	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF131	P52739	623 aa		23.88	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		23.88	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		23.88	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	USP49	Q70CQ1	688 aa		23.88	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	GPBP1	Q86WP2	473 aa		23.88	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	EPSTI1	Q96J88	318 aa		23.88	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		23.88	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		23.88	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		23.88	■■□□□ 1.41

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