RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 KRT3P12035 628 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 CRY2Q49AN0 593 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 LRRC43Q8N309 656 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 ANKS4BQ8N8V4 417 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 KCTD6Q8NC69 237 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 KRT35Q92764 455 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 SH3KBP1Q96B97 665 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 ZWILCHQ9H900 591 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 DYRK3O43781 588 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 ZBED1O96006 694 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 SELPP16109 830 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 TCP1P17987 556 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 PLCG1P19174 1290 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 ATICP31939 592 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 FANCCQ00597 558 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 ME3Q16798 604 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 ZSCAN30Q86W11 494 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 CD99L2Q8TCZ2 262 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 TSC1Q92574 1164 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 NT5C1AQ9BXI3 368 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 BAG5Q9UL15 447 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 CEP104O60308 925 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 PLA2G6O60733 806 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 GSTA1P08263 222 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 GSTA2P09210 222 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 MCM6Q14566 821 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 C7orf61Q8IZ16 206 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 PBXIP1Q96AQ6 731 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 ARHGEF26Q96DR7 871 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 FAM213AQ9BRX8 229 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 GPR88Q9GZN0 384 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 HIPK3Q9H422 1215 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 KIAA1468Q9P260 1216 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 RNF14Q9UBS8 474 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 SRRDQ9UH36 339 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 SLIT3O75094 1523 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 COL1A2P08123 1366 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 MEIS1O00470 390 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 VWA5AO00534 786 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 PDXKO00764 312 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 ASGR1P07306 291 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 MCF2P10911 925 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 CYP11B2P19099 503 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 CD58P19256 250 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF445P59923 1031 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 GRIK4Q16099 956 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 CYB5D1Q6P9G0 228 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 CCDC25Q86WR0 208 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 FBXL13Q8NEE6 735 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 RBSNQ9H1K0 784 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 BLZF1Q9H2G9 400 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF148Q9UQR1 794 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 OGTO15294 1046 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 IFNB1P01574 187 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 LEMD2Q8NC56 503 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 NMRK2Q9NPI5 230 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 NLRC4Q9NPP4 1024 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 RWDD2AQ9UIY3 292 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 TLK1Q9UKI8 766 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 SPACA6W5XKT8 324 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 M0QYV0 167 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 SEPT4O43236 478 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 COBLO75128 1261 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 KRT1P04264 644 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 VAMP7P51809 220 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 MTFR1Q15390 333 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 C8orf74Q6P047 294 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 IL17RAQ96F46 866 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 PCIF1Q9H4Z3 704 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 HAUS4Q9H6D7 363 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 GCNT4Q9P109 453 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 ASMTLO95671 621 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 BSPRYQ5W0U4 402 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 RASGRP4Q8TDF6 673 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 CYP3A43Q9HB55 503 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms