RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	APOL5	Q9BWW9	433 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	RSAD1	Q9HA92	442 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	PPCS	Q9HAB8	311 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	5.1	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	GALNT8	Q9NY28	637 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	IL13	P35225	146 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	GDF5	P43026	501 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	TRAPPC10	P48553	1259 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308		Q8N1X5	172 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	CALML6	Q8TD86	181 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	KAT5	Q92993	513 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	TNIP3	Q96KP6	325 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	TBCB	Q99426	244 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	MYD88	Q99836	296 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	CD248	Q9HCU0	757 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	DMTF1	Q9Y222	760 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNHG1-222	ENST00000545308	TSPOAP1	O95153	1857 aa		5.09	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	PBRM1	Q86U86	1689 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC189	A1A4V9	331 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	TCEA3	O75764	348 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	PAX3	P23760	479 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR15	P49685	360 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	MAP2K6	P52564	334 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF220	Q5VTB9	566 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	DNER	Q8NFT8	737 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	SOX7	Q9BT81	388 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	KLC2	Q9H0B6	622 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	OR10A5	Q9H207	317 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	GREM2	Q9H772	168 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	CAPN8	A6NHC0	703 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	GOLIM4	O00461	696 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR42	O15529	346 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	PPFIA4	O75335	1185 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	CYP7B1	O75881	506 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	IL18BP	O95998	194 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	PEX2	P28328	305 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	ACVRL1	P37023	503 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	HMGA2	P52926	109 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	EPHB4	P54760	987 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	ANTXR2	P58335	489 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	PPP2CB	P62714	309 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	PPP2CA	P67775	309 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	IL13RA1	P78552	427 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	SEPT2	Q15019	361 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	STIL	Q15468	1287 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	PHF19	Q5T6S3	580 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	KANK2	Q63ZY3	851 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	VASN	Q6EMK4	673 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	DTX3	Q8N9I9	347 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	SGCZ	Q96LD1	299 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		5.07	□□□□□ -1.6

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