RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523936.5

RPS20-210, Transcript of ribosomal protein S20, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RPS20, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS20-210ENST00000523936 FAM205CA6NFA0 338 aa21.35■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 B4GALT5O43286 388 aa21.35■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 ZMYND10O75800 440 aa21.35■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 C8orf34Q49A92 452 aa21.35■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 TNFRSF25Q93038 417 aa21.35■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa21.35■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 PCDHA12Q9UN75 941 aa21.35■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 PFKFB2O60825 505 aa21.34■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 NPTXRO95502 500 aa21.34■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 RPL17P18621 184 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 RFX1P22670 979 aa21.34■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 RARRES1P49788 294 aa21.34■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 GLYCTKQ8IVS8 523 aa21.34■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 ARHGEF3Q9NR81 526 aa21.34■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 PATJQ8NI35 1801 aa21.34■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 DMXL1Q9Y485 3027 aa21.34■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 CTDNEP1O95476 244 aa21.33■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 LMNAP02545 664 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 NR5A1Q13285 461 aa21.33■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 RTP2Q5QGT7 225 aa21.33■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 RABGGTAQ92696 567 aa21.33■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 KLK14Q9P0G3 267 aa21.33■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 FBXW11Q9UKB1 542 aa21.33■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.33■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 SIT1Q9Y3P8 196 aa21.33■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 NUMBLQ9Y6R0 609 aa21.33■■□□□ 1.01
RPS20-210ENST00000523936 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.32■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 TADA2AO75478 443 aa21.32■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.32■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 KRT2P35908 639 aa21.32■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 TUSC3Q13454 348 aa21.32■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.32■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 PRIMPOLQ96LW4 560 aa21.32■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 PAAF1Q9BRP4 392 aa21.32■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 PARP2Q9UGN5 583 aa21.32■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 DTNBO60941 627 aa21.31■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 DCNP07585 359 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 FSHRP23945 695 aa21.31■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 CALCRLQ16602 461 aa21.31■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa21.31■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 PIK3R5Q8WYR1 880 aa21.31■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 WASF1Q92558 559 aa21.31■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 CLSTN3Q9BQT9 956 aa21.31■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 CACNG4Q9UBN1 327 aa21.31■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 R4GN57 208 aa21.31■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP21.3■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 STARD6P59095 220 aa21.3■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 FAM187BQ17R55 369 aa21.3■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 SPECC1Q5M775 1068 aa21.3■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 C1orf210Q8IVY1 113 aa21.3■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.3■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 PIGOQ8TEQ8 1089 aa21.3■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 FGF14Q92915 247 aa21.3■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 TTPALQ9BTX7 342 aa21.3■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 FZD8Q9H461 694 aa21.3■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 CDH7Q9ULB5 785 aa21.3■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 CEP250Q9BV73 2442 aa21.3■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 SP9P0CG40 484 aa21.29■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 HOXA9P31269 272 aa21.29■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 ANKRD1Q15327 319 aa21.29■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 NAB2Q15742 525 aa21.29■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 PJA1Q8NG27 643 aa21.29■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 MTMR9Q96QG7 549 aa21.29■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.29■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 FRYLO94915 3013 aa21.29■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 LRRIQ4A6NIV6 560 aa21.28■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 PTGESO14684 152 aa21.28■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 USO1O60763 962 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 KIF4AO95239 1232 aa21.28■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 GLULP15104 373 aa21.28■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 TXKP42681 527 aa21.28■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 GPC5P78333 572 aa21.28■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 PSMD5Q16401 504 aa21.28■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 FAM171A1Q5VUB5 890 aa21.28■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 PARM1Q6UWI2 310 aa21.28■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 HASPINQ8TF76 798 aa21.28■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 SHDQ96IW2 340 aa21.28■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 FOXQ1Q9C009 403 aa21.28■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.28■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 COL4A3Q01955 1670 aa21.28■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 DNAH14Q0VDD8 3507 aa21.27■■□□□ 1
RPS20-210ENST00000523936 A0A087WWV3 80 aa21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms