RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515319.6

ZBED1-205, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene ZBED1, Length 905 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-205ENST00000515319 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 POLIQ9UNA4 740 aa17.37■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 ASPMQ8IZT6 3477 aa17.37■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 F8W810 466 aa17.36■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 DEXIO95424 95 aa17.36■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 USP41Q3LFD5 358 aa17.36■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 PRR16Q569H4 304 aa17.36■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 PPM1LQ5SGD2 360 aa17.36■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 LIN9Q5TKA1 542 aa17.36■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 KSR1Q8IVT5 923 aa17.36■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 ITFG1Q8TB96 612 aa17.36■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 COLEC11Q9BWP8 271 aa17.36■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa17.36■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 GREB1Q4ZG55 1949 aa17.36■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 ESYT2A0FGR8 921 aa17.35■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 CCL16O15467 120 aa17.35■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 CHMP2AO43633 222 aa17.35■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP17.35■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 CCR3P51677 355 aa17.35■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 ME3Q16798 604 aa17.35■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 FUT10Q6P4F1 479 aa17.35■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 CCDC148Q8NFR7 591 aa17.35■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 CRYGNQ8WXF5 182 aa17.35■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 MBOAT7Q96N66 472 aa17.35■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 CHRDQ9H2X0 955 aa17.35■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 UBN1Q9NPG3 1134 aa17.35■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 SH3GLB2Q9NR46 395 aa17.35■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 FBXW11Q9UKB1 542 aa17.35■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa17.35■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 NOTCH4Q99466 2003 aa17.35■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa17.34■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 XYLBO75191 536 aa17.34■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 ITGA4P13612 1032 aa17.34■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 NCLP19338 710 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 GNA11P29992 359 aa17.34■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 DSC1Q08554 894 aa17.34■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 SDK1Q7Z5N4 2213 aa17.34■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 GPR65Q8IYL9 337 aa17.34■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 GTF3C6Q969F1 213 aa17.34■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 SH2D3AQ9BRG2 576 aa17.34■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 IER2Q9BTL4 223 aa17.34■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 GPR62Q9BZJ7 368 aa17.34■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 ZMYND12Q9H0C1 365 aa17.34■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 C6orf50Q9HD87 102 aa17.34■□□□□ 0.37
ZBED1-205ENST00000515319 TMEM150BA6NC51 233 aa17.33■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 ARL5CA6NH57 179 aa17.33■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 C8AP07357 584 aa17.33■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 MLH1P40692 756 aa17.33■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 JAK3P52333 1124 aa17.33■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 UBXN11Q5T124 520 aa17.33■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 MAMSTRQ6ZN01 415 aa17.33■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 NPAS3Q8IXF0 933 aa17.33■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 CNNM3Q8NE01 707 aa17.33■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 BICD2Q8TD16 824 aa17.33■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 GAD1Q99259 594 aa17.33■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 IFT122Q9HBG6 1241 aa17.33■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 ZZEF1O43149 2961 aa17.33■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 IGF2RP11717 2491 aa17.32■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 STK36Q9NRP7 1315 aa17.32■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa17.32■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 MAN2B1O00754 1011 aa17.32■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 ECI2O75521 394 aa17.32■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 C1QTNF9P0C862 333 aa17.32■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 SFNP31947 248 aa17.32■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 SCNN1GP51170 649 aa17.32■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 LIMK1P53667 647 aa17.32■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 XKR3Q5GH77 459 aa17.32■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa17.32■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 NECAB1Q8N987 351 aa17.32■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 ING5Q8WYH8 240 aa17.32■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 WASF1Q92558 559 aa17.32■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 CEP89Q96ST8 783 aa17.32■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa17.32■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 SPAG17Q6Q759 2223 aa17.31■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 SHISA7A6NL88 538 aa17.31■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa17.31■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 HRO43593 1189 aa17.31■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 GAS7O60861 476 aa17.31■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 MAFO75444 373 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 XBP1P17861 261 aa17.31■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 HOXA9P31269 272 aa17.31■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 CXCL12P48061 93 aa17.31■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 FNTBP49356 437 aa17.31■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 DNASE1L2Q92874 299 aa17.31■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 COL26A1Q96A83 441 aa17.31■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 ZFP42Q96MM3 310 aa17.31■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 LMAN1LQ9HAT1 526 aa17.31■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 MIOSQ9NXC5 875 aa17.31■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 VPS54Q9P1Q0 977 aa17.31■□□□□ 0.36
ZBED1-205ENST00000515319 ADAM28Q9UKQ2 775 aa17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms