RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505685.1

ZBED3-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ZBED3, Length 432 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-202ENST00000505685 MEIS3P2A8K0S8 358 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 GRM6O15303 877 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 RECQL4O94761 1208 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 GALTP07902 379 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 IDEP14735 1019 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 MLH1P40692 756 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 LIG4P49917 911 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 MCL1Q07820 350 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 GSE1Q14687 1217 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP10.22□□□□□ -0.77not detected■□□□□ 8.4
ZBED3-202ENST00000505685 POSTNQ15063 836 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 AAK1Q2M2I8 961 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 ZNF568Q3ZCX4 644 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 EEF1DP3Q658K8 133 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 DYMQ7RTS9 669 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 MAP4K3Q8IVH8 894 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 SLC39A11Q8N1S5 342 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 POF1BQ8WVV4 589 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 ACAP3Q96P50 834 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 FIZ1Q96SL8 496 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 APOL6Q9BWW8 343 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 TRIM9Q9C026 710 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 CDT1Q9H211 546 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 TLR9Q9NR96 1032 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 SLC38A7Q9NVC3 462 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 PANK4Q9NVE7 773 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 SNTG2Q9NY99 539 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 FAN1Q9Y2M0 1017 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 HES2Q9Y543 173 aa10.22□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 POMCP01189 267 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 THP07101 528 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 CLTAP09496 248 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 PFKFB1P16118 471 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 AKAP5P24588 427 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 SYKP43405 635 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 SCNN1GP51170 649 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 ASIC1P78348 528 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 DSC1Q08554 894 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 LONRF3Q496Y0 759 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 UNC13DQ70J99 1090 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 SFR1Q86XK3 245 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 CD302Q8IX05 232 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 COLGALT2Q8IYK4 626 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 GPR65Q8IYL9 337 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 MICALL1Q8N3F8 863 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 GSTCDQ8NEC7 633 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 IGSF21Q96ID5 467 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 ACCSQ96QU6 501 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 COLEC11Q9BWP8 271 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 STRA6Q9BX79 667 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 TMEM206Q9H813 350 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 HPSEQ9Y251 543 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa10.21□□□□□ -0.77
ZBED3-202ENST00000505685 EYSQ5T1H1 3165 aa10.21□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 MYH11P35749 1972 aa10.21□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 ABLIM1O14639 778 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 FSCN2O14926 492 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 OGTO15294 1046 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 PPP1R37O75864 691 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 DDHD2O94830 711 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 GCNT3O95395 438 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 EDN1P05305 212 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 KCNE1P15382 129 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 NMT1P30419 496 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 SLC11A1P49279 550 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 TUSC3Q13454 348 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 XKR4Q5GH76 650 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 KANK3Q6NY19 840 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 ZNF280BQ86YH2 543 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 HLA-CQ95604 372 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 ZFP42Q96MM3 310 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 UROC1Q96N76 676 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 GBP3Q9H0R5 595 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 CHMP5Q9NZZ3 219 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 THEGQ9P2T0 379 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 GDAQ9Y2T3 454 aa10.2□□□□□ -0.78
ZBED3-202ENST00000505685 IRAK3Q9Y616 596 aa10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms