RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 OR5M3Q8NGP4 307 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 MDM1Q8TC05 714 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 HDAC10Q969S8 669 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM176AQ96HP8 235 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 OR14A2Q96R54 314 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 C7orf25Q9BPX7 421 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 PDCD2LQ9BRP1 358 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 ENKD1Q9H0I2 346 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 BCO1Q9HAY6 547 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 ANLNQ9NQW6 1124 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 PMS2P1A4D2B8 440 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 WNT10BO00744 389 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 GPR42O15529 346 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 ENDOD1O94919 500 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 PDCP20941 246 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 LPOP22079 712 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 AKAP5P24588 427 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 CYP2C19P33261 490 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 CRHR1P34998 444 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 PTPN7P35236 360 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 NPEPPSP55786 919 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM214AQ32MH5 1076 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 C14orf80Q86SX3 495 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 TCEAL8Q8IYN2 117 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 MAGEB6Q8N7X4 407 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 CCHCR1Q8TD31 782 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 ARL8AQ96BM9 186 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 CLIP3Q96DZ5 547 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 TEPSINQ96N21 525 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 TCF25Q9BQ70 676 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 MAPKBP1O60336 1514 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 ZMYM3Q14202 1370 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 ADGRL1O94910 1474 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 FOXS1O43638 330 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 AP1G1O43747 822 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 OFD1O75665 1012 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 GASTP01350 101 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 RPS19P39019 145 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 APBA1Q02410 837 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP4.24□□□□□ -1.732e-7■□□□□ 9.7
RABGGTB-211ENST00000489450 GRM7Q14831 915 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 NXNQ6DKJ4 435 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 TCTN3Q6NUS6 607 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 USP45Q70EL2 814 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 FUKQ8N0W3 1084 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 PRR18Q8N4B5 295 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 STON2Q8WXE9 905 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 HPS3Q969F9 1004 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 IL17RAQ96F46 866 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 CEP95Q96GE4 821 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 C20orf173Q96LM9 149 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 AIFM3Q96NN9 605 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 NELFAQ9H3P2 528 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 NMRK2Q9NPI5 230 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 LANCL2Q9NS86 450 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 RTEL1Q9NZ71 1219 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 DTNBO60941 627 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 AMY1AP04745 511 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 HSPA6P17066 643 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 SYN1P17600 705 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 ATF3P18847 181 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 FPR1P21462 350 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 PCSK1P29120 753 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 GUCY1A2P33402 732 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 GZMKP49863 264 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 DSC2Q02487 901 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 FOXL1Q12952 345 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 GTF2H3Q13889 308 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 ATAT1Q5SQI0 421 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 MFSD14BQ5SR56 506 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM111BQ6SJ93 734 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 GLB1LQ6UWU2 654 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 B3GNT9Q6UX72 402 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 MVB12AQ96EY5 273 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-211ENST00000489450 BDH2Q9BUT1 245 aa4.23□□□□□ -1.73
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