RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469694.5

GPC1-208, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 2,862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-208ENST00000469694 DAW1Q8N136 415 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 SEC14L1Q92503 715 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 ADAM7Q9H2U9 754 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 STK24Q9Y6E0 443 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 PARP14Q460N5 1801 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 UBOX5O94941 541 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 NPEPPSP55786 919 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 ODR4Q5SWX8 454 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 PADI6Q6TGC4 694 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 ERICH1Q86X53 443 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 CDCA5Q96FF9 252 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 ASTN1O14525 1302 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 CCDC188H7C350 402 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 HIP1RO75146 1068 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 SPDYCQ5MJ68 293 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 FIZ1Q96SL8 496 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 PACSIN1Q9BY11 444 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 ACAD9Q9H845 621 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 PARVGQ9HBI0 331 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 GPRC5CQ9NQ84 441 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 AMACRQ9UHK6 382 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 A0A087X0T9 212 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 PPFIA2O75334 1257 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 P4HBP07237 508 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 FAM228BP0C875 321 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 POTEJP0CG39 1038 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 EPHX2P34913 555 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 RPS6KA3P51812 740 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 GALNTL6Q49A17 601 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 HOOK3Q86VS8 718 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 TXLNGYQ9BZA5 131 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 CCDC134Q9H6E4 229 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 CEP72Q9P209 647 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 ZFATQ9P243 1243 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 TGFB1I1O43294 461 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 AKAP3O75969 853 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 FDX1P10109 184 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 QARSP47897 775 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 SNX1Q13596 522 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 NIPA1Q7RTP0 329 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 ECT2Q9H8V3 914 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 TISP43B9A030 160 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 NOL4O94818 638 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 YWHABP31946 246 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 ZNF131P52739 623 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 MAPK7Q13164 816 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 SLC30A9Q6PML9 568 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 FAM178BQ8IXR5 827 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 PGM2Q96G03 612 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 SELENOSQ9BQE4 189 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 FAM114A2Q9NRY5 505 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
GPC1-208ENST00000469694 KRIT1O00522 736 aa14.89□□□□□ -0.03
GPC1-208ENST00000469694 NEFHP12036 1026 aa14.89□□□□□ -0.03
GPC1-208ENST00000469694 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
GPC1-208ENST00000469694 ATP4AP20648 1035 aa14.89□□□□□ -0.03
GPC1-208ENST00000469694 CCND2P30279 289 aa14.89□□□□□ -0.03
GPC1-208ENST00000469694 SSR1P43307 286 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
GPC1-208ENST00000469694 RARRES1P49788 294 aa14.89□□□□□ -0.03
GPC1-208ENST00000469694 OAZ1P54368 228 aa14.89□□□□□ -0.03
GPC1-208ENST00000469694 SOX10P56693 466 aa14.89□□□□□ -0.03
GPC1-208ENST00000469694 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
GPC1-208ENST00000469694 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.89□□□□□ -0.03
GPC1-208ENST00000469694 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.89□□□□□ -0.03
GPC1-208ENST00000469694 ANKRD35Q8N283 1001 aa14.89□□□□□ -0.03
GPC1-208ENST00000469694 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
GPC1-208ENST00000469694 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
GPC1-208ENST00000469694 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
GPC1-208ENST00000469694 OLFML3Q9NRN5 406 aa14.89□□□□□ -0.03
GPC1-208ENST00000469694 TBC1D22BQ9NU19 505 aa14.89□□□□□ -0.03
GPC1-208ENST00000469694 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
GPC1-208ENST00000469694 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa14.89□□□□□ -0.03
GPC1-208ENST00000469694 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
GPC1-208ENST00000469694 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa14.89□□□□□ -0.03
GPC1-208ENST00000469694 A8MUI8 341 aa14.89□□□□□ -0.03
GPC1-208ENST00000469694 BTNL10A8MVZ5 291 aa14.89□□□□□ -0.03
GPC1-208ENST00000469694 CETN3O15182 167 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms