RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456943.6

GMDS-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 2,308 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CGRRF1Q99675 332 aa18.78■□□□□ 0.6
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF286BP0CG31 522 aa18.74■□□□□ 0.59
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 MEI1Q5TIA1 1274 aa18.74■□□□□ 0.59
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 MPZL3Q6UWV2 235 aa18.74■□□□□ 0.59
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa18.74■□□□□ 0.59
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 EPS8L1Q8TE68 723 aa18.74■□□□□ 0.59
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RFFLQ8WZ73 363 aa18.74■□□□□ 0.59
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa18.73■□□□□ 0.59
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TMCO5BA8MYB1 307 aa18.73■□□□□ 0.59
GMDS-AS1-201ENST00000456943 H3BRB1 525 aa18.73■□□□□ 0.59
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP18.73■□□□□ 0.59
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MMP3P08254 477 aa18.73■□□□□ 0.59
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa18.73■□□□□ 0.59
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MORN1Q5T089 497 aa18.73■□□□□ 0.59
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ATF7IP2Q5U623 682 aa18.73■□□□□ 0.59
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RGMBQ6NW40 437 aa18.73■□□□□ 0.59
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