RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428678.1

UPK3BP1-201, Transcript of uroplakin 3B pseudogene 1, humanhuman

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Gene UPK3BP1, Length 509 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BP1-201ENST00000428678 GSTCDQ8NEC7 633 aa20.33■□□□□ 0.85
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UPK3BP1-201ENST00000428678 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
UPK3BP1-201ENST00000428678 FOXQ1Q9C009 403 aa20.33■□□□□ 0.85
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa20.33■□□□□ 0.85
UPK3BP1-201ENST00000428678 GJB4Q9NTQ9 266 aa20.33■□□□□ 0.85
UPK3BP1-201ENST00000428678 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa20.33■□□□□ 0.85
UPK3BP1-201ENST00000428678 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.33■□□□□ 0.85
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UPK3BP1-201ENST00000428678 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
UPK3BP1-201ENST00000428678 C1orf210Q8IVY1 113 aa20.32■□□□□ 0.84
UPK3BP1-201ENST00000428678 PJA1Q8NG27 643 aa20.32■□□□□ 0.84
UPK3BP1-201ENST00000428678 HASPINQ8TF76 798 aa20.32■□□□□ 0.84
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UPK3BP1-201ENST00000428678 ARL2P36404 184 aa20.31■□□□□ 0.84
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UPK3BP1-201ENST00000428678 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.31■□□□□ 0.84
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
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UPK3BP1-201ENST00000428678 TTPALQ9BTX7 342 aa20.29■□□□□ 0.84
UPK3BP1-201ENST00000428678 PCDHA12Q9UN75 941 aa20.29■□□□□ 0.84
UPK3BP1-201ENST00000428678 POLIQ9UNA4 740 aa20.29■□□□□ 0.84
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UPK3BP1-201ENST00000428678 KIF4AO95239 1232 aa20.28■□□□□ 0.84
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UPK3BP1-201ENST00000428678 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
UPK3BP1-201ENST00000428678 RARRES1P49788 294 aa20.28■□□□□ 0.84
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UPK3BP1-201ENST00000428678 CALCRLQ16602 461 aa20.28■□□□□ 0.84
UPK3BP1-201ENST00000428678 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.28■□□□□ 0.84
UPK3BP1-201ENST00000428678 MTSS1LQ765P7 747 aa20.28■□□□□ 0.84
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UPK3BP1-201ENST00000428678 CCL16O15467 120 aa20.27■□□□□ 0.84
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UPK3BP1-201ENST00000428678 GPRC5CQ9NQ84 441 aa20.27■□□□□ 0.84
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UPK3BP1-201ENST00000428678 KRT2P35908 639 aa20.26■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 UBXN2BQ14CS0 331 aa20.26■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 TMEM132AQ24JP5 1023 aa20.26■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 ITFG1Q8TB96 612 aa20.26■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 BCO2Q9BYV7 579 aa20.26■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.26■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
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