RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427230.2

NANOGP4-201, Transcript of Nanog homeobox pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene NANOGP4, Length 913 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP4-201ENST00000427230 SPC25Q9HBM1 224 aa6.52□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 CTNNA3Q9UI47 895 aa6.52□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa6.52□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.52□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 FRYQ5TBA9 3013 aa6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 GABPAQ06546 454 aa6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 TCEAL1Q15170 157 aa6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 CEP85Q6P2H3 762 aa6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 PRR23CQ6ZRP0 262 aa6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 RPAINQ86UA6 219 aa6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 AACSQ86V21 672 aa6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 ITPRIPQ8IWB1 547 aa6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 TMEM105Q8N8V8 129 aa6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 SDR42E1Q8WUS8 393 aa6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 RNF141Q8WVD5 230 aa6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 GATA6Q92908 595 aa6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 RIPOR3Q96MK2 946 aa6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 MMP19Q99542 508 aa6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 MYO10Q9HD67 2058 aa6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 SPEGQ15772 3267 aa6.51□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 WDR64B1ANS9 1081 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 CBFA2T2O43439 604 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 CABYRO75952 493 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 BAIAP3O94812 1187 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 GJB5O95377 273 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 CHGBP05060 677 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 ITGB2P05107 769 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 IQCF3P0C7M6 154 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 PDE6AP16499 860 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 CD247P20963 164 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 RFC2P35250 354 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 KCNJ6P48051 423 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 WDR5P61964 334 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 PSMC6P62333 389 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 RNF4P78317 190 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 DEFB103AP81534 67 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 ACVR2BQ13705 512 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 PTPROQ16827 1216 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 LCORLQ8N3X6 602 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 MB21D1Q8N884 522 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 DYNLL2Q96FJ2 89 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 CABP5Q9NP86 173 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 ASTN1O14525 1302 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 TNKSO95271 1327 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNF532Q9HCE3 1301 aa6.5□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 MYH6P13533 1939 aa6.49□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa6.49□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.49□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 ESYT3A0FGR9 886 aa6.49□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 FSD2A1L4K1 749 aa6.49□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 MEIS1O00470 390 aa6.49□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 NCK2O43639 380 aa6.49□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 PRKAB2O43741 272 aa6.49□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 F13BP05160 661 aa6.49□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 FAM153BP0C7A2 387 aa6.49□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 AKR1B1P15121 316 aa6.49□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 BECN1Q14457 450 aa6.49□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 PPP2R5DQ14738 602 aa6.49□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 GPNMBQ14956 572 aa6.49□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.49□□□□□ -1.37
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NANOGP4-201ENST00000427230 C20orf194Q5TEA3 1177 aa6.49□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 RNF43Q68DV7 783 aa6.49□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.49□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 CERS3Q8IU89 383 aa6.49□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.49□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.49□□□□□ -1.37
NANOGP4-201ENST00000427230 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
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