RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361320.4

LRRTM3-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM3, Length 4,358 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-201ENST00000361320 PI4K2AQ9BTU6 479 aa7.56□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 IFT122Q9HBG6 1241 aa7.56□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 MSRAQ9UJ68 235 aa7.56□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 RPTORQ8N122 1335 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 LRRD1A4D1F6 860 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 PHF20L1A8MW92 1017 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 HLA-DRAP01903 254 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC4A1P02730 911 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 LRG1P02750 347 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 LCP1P13796 627 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 EZRP15311 586 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 HSPA6P17066 643 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 RGS7P49802 495 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 EHHADHQ08426 723 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 DPYDQ12882 1025 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 GIT2Q14161 759 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 LONRF2Q1L5Z9 754 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 SPTLC3Q9NUV7 552 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 MROH7Q68CQ1 1323 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 TLDC2A0PJX2 215 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 SOWAHBA6NEL2 793 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 LGALS16A8MUM7 142 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 MUTP22033 750 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 NOP14P78316 857 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 PPP2R5CQ13362 524 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 SH3D19Q5HYK7 790 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 RFX6Q8HWS3 928 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 ADSSL1Q8N142 457 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 GAD1Q99259 594 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 IGFLR1Q9H665 355 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 DPP3Q9NY33 737 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 ROBO3Q96MS0 1386 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 FOXP2O15409 715 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 GJB1P08034 283 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 HMBSP08397 361 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 HOXC6P09630 235 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 SRGAP2BP0DMP2 458 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 CXCL8P10145 99 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 PSMA2P25787 234 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 RBM10P98175 930 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 NME3Q13232 169 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 FRMD5Q7Z6J6 570 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 GAS2L3Q86XJ1 694 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 CEP112Q8N8E3 955 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 GSDMBQ8TAX9 411 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF148Q9UQR1 794 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 BTAF1O14981 1849 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 SCN11AQ9UI33 1791 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 CD52P31358 61 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 HSD17B4P51659 736 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 ABRAQ8N0Z2 381 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 HVCN1Q96D96 273 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 SPON2Q9BUD6 331 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 MTMR12Q9C0I1 747 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 COL20A1Q9P218 1284 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 NRBP1Q9UHY1 535 aa7.55□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 CACNA1FO60840 1977 aa7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 CYP26A1O43174 497 aa7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 PSMD10O75832 226 aa7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 RALAP11233 206 aa7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 SDC4P31431 198 aa7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 CTXN3Q4LDR2 81 aa7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 LDLRAD1Q5T700 205 aa7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 CCDC63Q8NA47 563 aa7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 TRIM58Q8NG06 486 aa7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 RABGGTAQ92696 567 aa7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 HAUS1Q96CS2 278 aa7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 ZWILCHQ9H900 591 aa7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 RSAD1Q9HA92 442 aa7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC28A3Q9HAS3 691 aa7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 STAP1Q9ULZ2 295 aa7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 GOLGA6CA6NDK9 693 aa7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 GOLGA6BA6NDN3 693 aa7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 GNRH1P01148 92 aa7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 SERPING1P05155 500 aa7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 GOLGA6DP0CG33 693 aa7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 SMPD1P17405 629 aa7.54□□□□□ -1.2
LRRTM3-201ENST00000361320 SYN1P17600 705 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms