RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 CYTH3O43739 400 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 RALAP11233 206 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 MYOGP15173 224 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ITGB5P18084 799 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ADAM9Q13443 819 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 DUOXA2Q1HG44 320 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 OVOS1Q6IE37 1185 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 GJD3Q8N144 294 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 KLHL23Q8NBE8 558 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ALS2CR12Q96Q35 445 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SPON2Q9BUD6 331 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ASAH2Q9NR71 780 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 TLR9Q9NR96 1032 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 UMODL1Q5DID0 1318 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 NAV1Q8NEY1 1877 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D3BA6NDS4 549 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PP2D1A8MPX8 630 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF197O14709 1029 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ARIH2O95376 493 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ODC1P11926 461 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2HP62256 183 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 RBP5P82980 135 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC173Q0VFZ6 552 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SNX17Q15036 470 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PKN1Q16512 942 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 KYAT1Q16773 422 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF699Q32M78 642 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 UAP1L1Q3KQV9 507 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SLC27A1Q6PCB7 646 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF410Q86VK4 478 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SFR1Q86XK3 245 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CASP10Q92851 521 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SHDQ96IW2 340 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CIPCQ9C0C6 399 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 TUFT1Q9NNX1 390 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ATP2A1O14983 1001 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 TBX3O15119 743 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CCL16O15467 120 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 FGF18O76093 207 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 BAIAP3O94812 1187 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CLTAP09496 248 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CYP11B2P19099 503 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 MTHFRP42898 656 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 TAF6P49848 677 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGAP1Q07960 439 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 STARD3Q14849 445 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 GIPC2Q8TF65 315 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC113Q9H0I3 377 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 LMBRD1Q9NUN5 540 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 LIMD1Q9UGP4 676 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CD207Q9UJ71 328 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CLIC4Q9Y696 253 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ADCY1Q08828 1119 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ITKQ08881 620 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ATL3Q6DD88 541 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 IL31Q6EBC2 164 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP4.79□□□□□ -1.641e-6■■■□□ 18.7
PTPRC-201ENST00000348564 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 OTUD6BQ8N6M0 293 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 TNIP3Q96KP6 325 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 C17orf80Q9BSJ5 609 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CSRNP2Q9H175 543 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 COL20A1Q9P218 1284 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SERTAD1Q9UHV2 236 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PLIN4Q96Q06 1357 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ESYT2A0FGR8 921 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 FAM205CA6NFA0 338 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SMTNL1A8MU46 457 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 FAM86B1E9PN63 330 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CYB561D2O14569 222 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 RECQL4O94761 1208 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 EYA4O95677 639 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 FAM86B2P0C5J1 330 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ACADMP11310 421 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 RPL17P18621 184 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ACTN2P35609 894 aa4.78□□□□□ -1.64
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