RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGEF9O43307 516 aa25.53■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 SCP2P22307 547 aa25.53■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 USP11P51784 963 aa25.53■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 TSPY1Q01534 308 aa25.53■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.53■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa25.53■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 EHD2Q9NZN4 543 aa25.53■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM196BA6NMK8 535 aa25.53■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 PHF20L1A8MW92 1017 aa25.53■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 DPYDQ12882 1025 aa25.53■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 MBD5Q9P267 1494 aa25.53■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 NEK2P51955 445 aa25.53■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 RABGAP1LQ5R372 815 aa25.53■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 STOX1Q6ZVD7 989 aa25.53■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa25.53■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 SERPINB4P48594 390 aa25.53■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 P3H1Q32P28 736 aa25.53■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 ACAP3Q96P50 834 aa25.53■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 EGFL8Q99944 293 aa25.53■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 KLHL11Q9NVR0 708 aa25.53■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 PRAMEP78395 509 aa25.52■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 NPHS2Q9NP85 383 aa25.52■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa25.52■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 CYTH1Q15438 398 aa25.52■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 DTX3LQ8TDB6 740 aa25.52■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 HPS3Q969F9 1004 aa25.52■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF212Q9UDV6 495 aa25.52■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF2CQ99661 725 aa25.52■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 TEX2Q8IWB9 1127 aa25.52■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 SPATA17Q96L03 361 aa25.52■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 SP110Q9HB58 689 aa25.52■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 AURKCQ9UQB9 309 aa25.52■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 RCOR2Q8IZ40 523 aa25.52■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 SYNE4Q8N205 404 aa25.52■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD7Q92527 254 aa25.52■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 TSSK1BQ9BXA7 367 aa25.52■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM10Q9UDY6 481 aa25.52■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 LAMC1P11047 1609 aa25.51■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 ORC4O43929 436 aa25.51■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 EYA4O95677 639 aa25.51■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 NR1I3Q14994 352 aa25.51■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP25.51■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 SHROOM2Q13796 1616 aa25.51■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 AP3M2P53677 418 aa25.51■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM182BQ5T319 152 aa25.51■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 TTC39CQ8N584 583 aa25.51■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 STXBP3O00186 592 aa25.51■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 AGBL2Q5U5Z8 902 aa25.51■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 SEC16BQ96JE7 1060 aa25.51■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP1R36Q96LQ0 422 aa25.51■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXO40Q9UH90 709 aa25.51■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 CEP170Q5SW79 1584 aa25.51■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 ADSSL1Q8N142 457 aa25.51■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 MASTLQ96GX5 879 aa25.51■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 SH3GL3Q99963 347 aa25.51■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM9Q9C026 710 aa25.51■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 CD209Q9NNX6 404 aa25.51■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 PYGLP06737 847 aa25.5■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 NMT1P30419 496 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 CNGA3Q16281 694 aa25.5■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 HAUS6Q7Z4H7 955 aa25.5■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 PBXIP1Q96AQ6 731 aa25.5■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 HOXC10Q9NYD6 342 aa25.5■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 ZFATQ9P243 1243 aa25.5■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 ERFP50548 548 aa25.5■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 HLA-DPA1P20036 260 aa25.5■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.5■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP9BO43861 1147 aa25.5■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 ITIH2P19823 946 aa25.5■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF146Q9NTX7 359 aa25.5■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF711Q9Y462 761 aa25.5■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.49■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNN4O15554 427 aa25.49■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNA2P16389 499 aa25.49■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 OR6P1Q8NGX9 317 aa25.49■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 STK33Q9BYT3 514 aa25.49■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 PDIA5Q14554 519 aa25.49■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 UNC45AQ9H3U1 944 aa25.49■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa25.49■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 PID1Q7Z2X4 250 aa25.49■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 OR2W6PQ8NHA6 318 aa25.49■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 LZICQ8WZA0 190 aa25.49■■□□□ 1.67
GNPTAB-201ENST00000299314 ADAM33Q9BZ11 813 aa25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms