RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000276105.3

SNX12-201, Transcript of sorting nexin 12, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 3 BASIC

Gene SNX12, Length 720 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12-201ENST00000276105 KRT79Q5XKE5 535 aa11.16□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 FUT10Q6P4F1 479 aa11.16□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 BSNDQ8WZ55 320 aa11.16□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 PBXIP1Q96AQ6 731 aa11.16□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 BHMT2Q9H2M3 363 aa11.16□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 PDZD7Q9H5P4 517 aa11.16□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 C17orf75Q9HAS0 396 aa11.16□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 FNIP2Q9P278 1114 aa11.16□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 PARP2Q9UGN5 583 aa11.16□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 KCNG1Q9UIX4 513 aa11.16□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 SORCS3Q9UPU3 1222 aa11.16□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 KIAA1024Q9UPX6 916 aa11.16□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 DNM3Q9UQ16 869 aa11.16□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 ZFHX4Q86UP3 3567 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 DENND4AQ7Z401 1863 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 C2CD4DB7Z1M9 353 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 TEX28O15482 410 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 STX6O43752 255 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 GLUD1P00367 558 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 THP07101 528 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 SYT1P21579 422 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 NUBP1P53384 320 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 MTMR3Q13615 1198 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 ECM1Q16610 540 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 TMEM132AQ24JP5 1023 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 DTHD1Q6ZMT9 781 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 CCDC149Q6ZUS6 474 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 OTOP3Q7RTS5 596 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 ZBTB33Q86T24 672 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 FBXL6Q8N531 539 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 SNX29Q8TEQ0 813 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 ASIC4Q96FT7 647 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 DRC1Q96MC2 740 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 TIPINQ9BVW5 301 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 ADAM28Q9UKQ2 775 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa11.15□□□□□ -0.62
SNX12-201ENST00000276105 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 MYO10Q9HD67 2058 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 K7ERI5 159 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 C2CD2LO14523 706 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 SLC26A4O43511 780 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 TADA2AO75478 443 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 NBR1Q14596 966 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 HYIQ5T013 277 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 PDXDC1Q6P996 788 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 TMC5Q6UXY8 1006 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 KREMEN2Q8NCW0 462 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 STAMQ92783 540 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 TMEM134Q9H6X4 195 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 MAN1C1Q9NR34 630 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 KLK14Q9P0G3 267 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 TNFSF13BQ9Y275 285 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 C5orf42Q9H799 3197 aa11.14□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 PTGESO14684 152 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 RECQL4O94761 1208 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 ATF7IP2Q5U623 682 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 TAS1R1Q7RTX1 841 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 UROC1Q96N76 676 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 GPR62Q9BZJ7 368 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 NT5C3AQ9H0P0 336 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 SNTG2Q9NY99 539 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 KCND2Q9NZV8 630 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 CDH22Q9UJ99 828 aa11.13□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 TTLL13PA6NNM8 815 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 BMP15O95972 392 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 WEE2P0C1S8 567 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 SP100P23497 879 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 GUCY2CP25092 1073 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 NPTX2P47972 431 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 PTPN5P54829 565 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 PEX3P56589 373 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 NUCB2P80303 420 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 NHLH1Q02575 133 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 NAB2Q15742 525 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 EEF1DP3Q658K8 133 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 RINT1Q6NUQ1 792 aa11.12□□□□□ -0.63
SNX12-201ENST00000276105 KANK3Q6NY19 840 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms