RNA–Protein interactions for RNA: YPR057W

BRR1, Transcript of snRNP protein component of spliceosomal snRNPs, yeastyeast

Gene BRR1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRR1YPR057W CAT5P41735 233 aa8.32□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W ECO1P43605 281 aa8.32□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W VHT1P53241 593 aa8.32□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W YGR066CP53242 292 aa8.32□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W BSC5P53755 489 aa8.32□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W CTS2Q06350 511 aa8.32□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W ORT1Q12375 292 aa8.32□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W SCEIP03882 235 aa8.31□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W SPO7P18410 259 aa8.31□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W SAR1P20606 190 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W UTR1P21373 530 aa8.31□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W NFS1P25374 497 aa8.31□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W LDB16P25587 256 aa8.31□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W CPR3P25719 182 aa8.31□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W NAM9P27929 486 aa8.31□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W MRPL3P36516 390 aa8.31□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W SER3P40054 469 aa8.31□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W DLS1P40366 167 aa8.31□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W SYS1P41544 203 aa8.31□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W AIM25P47140 327 aa8.31□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W MSY1P48527 492 aa8.31□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W YIP4P53093 235 aa8.31□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W MTL1P53214 551 aa8.31□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W PDR16P53860 351 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W SAM50P53969 484 aa8.31□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W YDR209CQ03480 137 aa8.31□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W RAD52P06778 471 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W YFR010W-AP0C5N0 62 aa8.3□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W NUD1P32336 851 aa8.3□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W PPG1P32838 368 aa8.3□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W FRM2P37261 193 aa8.3□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W APD1P38281 316 aa8.3□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W SLZ1P40167 298 aa8.3□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W TIR3P40552 269 aa8.3□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W MNN5P46982 586 aa8.3□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W LYS5P50113 272 aa8.3□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W FMP48P53233 369 aa8.3□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W RSM10Q03201 203 aa8.3□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W YDR102CQ03864 110 aa8.3□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W HEM25Q07534 307 aa8.3□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W RRI1Q12468 440 aa8.3□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W FUR4P05316 633 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W NHP6BP11633 99 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W CDC23P16522 626 aa8.29□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W STF2P16965 84 aa8.29□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W GRX2P17695 143 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W DIT1P21623 536 aa8.29□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W MDH2P22133 377 aa8.29□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W SNC2P33328 115 aa8.29□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W SSH1P38353 490 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W VMA22P38784 181 aa8.29□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W IKS1P47042 667 aa8.29□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W POP6P53218 158 aa8.29□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W PBP1P53297 722 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W SLI1P53304 468 aa8.29□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W SCW4P53334 386 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W HOL1P53389 586 aa8.29□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W CTF19Q02732 369 aa8.29□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W UTP15Q04305 513 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W GAS2Q06135 555 aa8.29□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W FLO9P39712 1322 aa8.29□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W CHO1P08456 276 aa8.28□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W RNA14P25298 677 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W YCP4P25349 247 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W DBF20P32328 564 aa8.28□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W TAT1P38085 619 aa8.28□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W AIM3P38266 947 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W PUG1P40100 303 aa8.28□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W YIL060WP40519 144 aa8.28□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W UBX6P47049 396 aa8.28□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W GPI14P47088 403 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W ATG4P53867 494 aa8.28□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W BUD25P85052 153 aa8.28□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W TY1A-MR1Q04215 440 aa8.28□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W BRR2P32639 2163 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
BRR1YPR057W YLR358CO13565 187 aa8.27□□□□□ -1.09
BRR1YPR057W PRB1P09232 635 aa8.27□□□□□ -1.09
BRR1YPR057W PET18P25362 215 aa8.27□□□□□ -1.09
BRR1YPR057W SOF1P33750 489 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
BRR1YPR057W BUD8P41698 603 aa8.27□□□□□ -1.09
BRR1YPR057W PRY1P47032 299 aa8.27□□□□□ -1.09
BRR1YPR057W GPG1P53130 126 aa8.27□□□□□ -1.09
BRR1YPR057W ORM1P53224 222 aa8.27□□□□□ -1.09
BRR1YPR057W YGR042WP53227 271 aa8.27□□□□□ -1.09
BRR1YPR057W AAH1P53909 347 aa8.27□□□□□ -1.09
BRR1YPR057W NGL2Q03264 515 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
BRR1YPR057W YPL272CQ08984 517 aa8.27□□□□□ -1.09
BRR1YPR057W TGS1Q12052 315 aa8.27□□□□□ -1.09
BRR1YPR057W YRM1Q12340 786 aa8.27□□□□□ -1.09
BRR1YPR057W FSH3Q99369 266 aa8.27□□□□□ -1.09
BRR1YPR057W CSF1Q12150 2958 aa8.27□□□□□ -1.09
BRR1YPR057W SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
BRR1YPR057W SGA1P08019 549 aa8.26□□□□□ -1.09
BRR1YPR057W GCD1P09032 578 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
BRR1YPR057W RPL3P14126 387 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
BRR1YPR057W SEC62P21825 274 aa8.26□□□□□ -1.09
BRR1YPR057W NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data8.26□□□□□ -1.09not detected
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